Het belangrijkste verschil tussen ORF en exon is dat het ORF of het open leesraam een stuk DNA-sequentie is die begint met de translatie-initiatieplaats (startcodon) en eindigt met de translatieterminatieplaats (stopcodon) terwijl exon een nucleotidesequentie binnen een gen dat codeert voor aminozuren.
Een open leesraam is een onderdeel van een leesraam. Leesframes worden gelezen door ribosomen om eiwitten te maken. ORF is een continu stuk codons dat een volledig functioneel eiwit geeft. Het begint met een startcodon en eindigt met een stopcodon. Binnen het ORF is er geen stopcodon dat de coderende sequentie onderbreekt. De vertaling begint bij het startcodon en eindigt bij het stopcodon. Exon is een nucleotidesequentie van een gen. Het codeert voor aminozuren van het eiwit. Daarom zijn exons coderende gebieden van een gen.
Wat is een ORF?
Open leesraam of ORF is het continue stuk van een nucleotidesequentie die begint met een startcodon en eindigt met een stopcodon. In eenvoudige bewoordingen verwijst ORF naar het gebied van de nucleotidesequentie die zich tussen de start- en stopcodons bevindt. Daartussen is er geen stopcodon dat de ORF onderbreekt. De nucleotidesequentie tussen start- en stopcodon codeert voor aminozuren. Over het algemeen is startcodon ATG, terwijl stopcodons TAG, TAA en TGA zijn. ORF geeft een functioneel eiwit wanneer het wordt getranscribeerd en vertaald. Daarom omvat ORF een startcodon, verschillende codons in het middengebied en een stopcodon. Interessant is dat ORF een lengte heeft die kan worden gedeeld door drie.
Figuur 01: ORF
In prokaryoten is ORF, aangezien er geen introns zijn, het coderende gebied van een gen dat direct in mRNA wordt omgezet. In eukaryoten is ORF, aangezien er introns zijn, de codonsequentie die ontstaat na verwerking of RNA-splitsing. ORF is een stukje bewijs dat helpt bij het voorspellen van genen, aangezien lange ORF's waarschijnlijk deel uitmaken van een gen.
Wat is een Exon?
Exons zijn de coderende nucleotidesequenties van genen die zich vertalen in eiwitten. Ze bevinden zich aan weerszijden van een intron. Na het verwijderen van niet-coderende sequenties uit het pre-mRNA, bestaat het rijpe mRNA-molecuul alleen uit exon-sequenties. Vervolgens wordt de nucleotidesequentie van het uiteindelijke RNA-molecuul (rijp mRNA) omgezet in een aminozuursequentie van een specifiek eiwit.
Figuur 02: Exons
Bijna alle genen hebben een initiële nucleotidesequentie die het als een gen onderscheidt van de belangrijkste DNA- of RNA-streng, die bekend staat als het Open Reading Frame (ORF. In sommige genen markeren twee ORF's het hele gen en exons bevinden zich binnen de coderende sequentie. Hoewel het klinkt dat exons altijd tot expressie worden gebracht in genen, zijn er gevallen waarin intronsequenties tussenbeide komen met het exon om mutaties te veroorzaken, en dit proces staat bekend als exonisatie.
Wat zijn de overeenkomsten tussen ORF en Exon?
- Zowel ORF als exon zijn nucleotidesequenties.
- Lange ORF en exons zijn delen van een gen.
- Beide hebben coderende sequenties.
Wat is het verschil tussen ORF en Exon?
ORF en exon zijn nucleotidesequenties. ORF verwijst naar elk stuk DNA-sequentie dat zich tussen een startcodon en een stopcodon bevindt. Het exon daarentegen is een coderende nucleotidesequentie van een gen dat codeert voor aminozuren. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen ORF en exon. Exons zijn delen van een gen, terwijl lange ORF waarschijnlijk een deel van een gen is. Bovendien zijn er introns aan beide zijden van een exon, terwijl ORF geen introns bevat.
De onderstaande infographic vat het verschil tussen ORF en exon in tabelvorm samen.
Samenvatting – ORF vs Exon
Het open leesraam (ORF) is een onderdeel van het leesraam. Het is het continue stuk DNA-sequentie dat begint met een startcodon en eindigt met een stopcodon. Exon is een nucleotidesequentie van een gen. Het codeert voor een deel van de mRNA-sequentie. Daarom zijn exons delen van de gensequentie die tot expressie worden gebracht in het eiwit. Dit vat dus het verschil tussen ORF en exon samen.
