Belangrijk verschil - Minisatelliet versus microsatelliet
Repetitief DNA zijn de nucleotidesequenties die zich steeds weer herhalen in het genoom van organismen. Repetitief DNA is goed voor een aanzienlijk deel van het genomische DNA en er zijn drie hoofdtypen genaamd tandemherhalingen, terminale herhalingen en afgewisselde herhalingen. Tandemherhalingen zijn de zeer herhaalde reeksen die zonder onderbreking naast elkaar liggen. Er zijn drie hoofdtypen tandemherhalingen in het genoom van gewervelde dieren. Het zijn satelliet-DNA, microsatelliet-DNA en minisatelliet-DNA. Minisatelliet is een sectie van sterk herhaald DNA dat bestaat uit een reeks van een herhalende sequentie die bestaat uit 10 tot 100 basenparen. Microsatelliet is een sectie van repetitief DNA die bestaat uit korte herhalende sequenties die zijn samengesteld uit 1 tot 9 basenparen. Daarom is het belangrijkste verschil tussen minisatelliet en microsatelliet de grootte of de lengte van de herhalende reeks.
Wat is een minisatelliet?
Minisatelliet-DNA is een DNA-sectie die een reeks korte DNA-herhalende sequenties omvat met een lengte van 10 tot 60 basenparen. Minisatellieten worden ook wel Variable Number Tandem Repeats (VNTR) genoemd. Minisatellieten worden vaak verward met microsatellieten. Minisatellieten en microsatellieten worden nu echter door wetenschappers onderscheiden op basis van de grootte van de herhalende reeks.
Minisatellieten zijn te zien op meer dan 1000 locaties in het menselijk genoom. Deze korte reeksen zijn rijk aan G en C. Het aantal herhalingen in een bepaalde minisatelliet varieert sterk van persoon tot persoon.
De eerste menselijke minisatelliet werd in 1980 geïdentificeerd door A. R. Wyman en R. White. Later ontdekte Alec Jeffreys het extreme polymorfisme van het aantal kopieën van minisatellieten onder organismen. Die ontdekkingen maakten minisatellieten tot ideale markers voor DNA-vingerafdrukken, koppelingsanalyse en populatiestudies. Minisatellieten dragen ook bij aan de regulering van genexpressie, transcriptie, alternatieve splicing, enz.
Wat is een microsatelliet?
Microsatelliet is een stukje DNA met eenvoudige herhalingen van sequenties van 1 tot 10 basenparen lang. Microsatellieten worden ook wel short sequence repeats (SSR) of simple tandem repeats (STR) genoemd. Er zijn twee soorten microsatellieten, eenvoudige microsatellieten en samengestelde microsatellieten. Eenvoudige microsatellieten bestaan uit slechts één type herhaalde sequenties. Composiet microsatellieten bestaan uit meer dan één type herhalingen. Microsatellieten bezitten meestal poly A/T-regio's. Microsatellieten zijn codominant en komen veel voor in eukaryote genomen.
Net als minisatellieten vertonen microsatellieten ook polymorfisme tussen individuen. Het aantal herhalingen voor een bepaalde microsatelliet varieert van persoon tot persoon. Daarom kunnen microsatellieten ook worden gebruikt als genetische markers bij DNA-fingerprinting. Microsatellietpolymorfisme kan gemakkelijk worden geïdentificeerd door PCR en gelelektroforese. Het flankerende gebied van microsatelliet is sterk geconserveerd in verwante soorten.
Wat zijn de overeenkomsten tussen minisatelliet en microsatelliet?
- Minisatellieten en microsatellieten zijn niet-coderende DNA-sequenties.
- Beide zijn tandemherhalingen.
- Beide bestaan uit sterk herhalende reeksen.
- Beide kunnen worden gebruikt als krachtige genetische markers voor DNA-fingerprinting.
Wat is het verschil tussen minisatelliet en microsatelliet?
Minisatelliet vs Microsatelliet |
|
| Minisatellieten zijn tandemherhalingen met een monomeerherhalingslengte van 10 tot 100 basenparen. | Microsatellieten zijn korte tandem-herhalingen die bestaan uit 1 tot 9 basenparen herhalende monomeersequenties. |
| Grootte van de herhalende reeks | |
| Minisatelliet heeft herhalende reeksen van 10 tot 100 basenparen. | Microsatelliet heeft korte reeksen van 1 tot 9 basenparen. |
| Gemeenschappelijke basissen | |
| Minisatellieten zijn rijk aan G- en C-basen. | Microsatellieten zijn rijk aan A- en T-basen. |
| Andere namen | |
| Minisatellieten worden ook wel Variable Number Tandem Repeats (VNTR) genoemd. | Microsatellieten worden ook wel short sequence repeats (SSR) of simple tandem repeats (STR) genoemd. |
Samenvatting – Minisatelliet vs Microsatelliet
Minisatelliet en microsatelliet zijn twee soorten tandemherhalingen. Ze worden onderscheiden op basis van het aantal basen in de herhalende sequentie of de grootte van de sequentie. Minisatelliet heeft een herhalende reeks van 10 tot 100 basenparen, terwijl microsatelliet een herhalende reeks van 1 tot 9 basenparen heeft. Dit is het belangrijkste verschil tussen minisatelliet en microsatelliet. Het aantal kopieën van de herhalende sequentie in minisatellieten en microsatellieten varieert sterk tussen individuen. Zowel minisatellieten als microsatellieten zijn krachtige DNA-markers voor het analyseren van genetische variatie binnen en tussen populaties van soorten.
Download de PDF-versie van Minisatellite vs Microsatellite
U kunt de PDF-versie van dit artikel downloaden en gebruiken voor offline doeleinden volgens de citatienotities. Download hier de PDF-versie. Verschil tussen minisatelliet en microsatelliet.
