Het belangrijkste verschil tussen VNTR en probe is dat VNTR een korte nucleotidesequentie is die voorkomt als een tandemherhaling in het genoom, terwijl een probe een kunstmatig gesynthetiseerde korte DNA- of RNA-sequentie is die radioactief kan worden gelabeld.
VNTR staat voor Variable Number Tandem Repeat. Het is een korte nucleotidesequentie die in tandemherhalingen in het genoom is georganiseerd. VNTR's komen van nature voor in ons genoom. Een probe is een kunstmatig gesynthetiseerde korte DNA- of RNA-sequentie. Zowel probe als VNTR zijn nucleïnezuren of korte nucleotidesequenties. Ze hebben een enorm gebruik in verschillende moleculair biologische technieken, voornamelijk in forensische studies. VNTR en sonde delen enkele overeenkomsten en verschillen. Daarom probeert het artikel het verschil tussen VNTR en probe te benadrukken.
Wat is een VNTR?
VNTR is een korte nucleotidesequentie die als tandemherhaling in ons genoom voorkomt. VNTR's zijn aanwezig in veel chromosomen. Bovendien verschillen VNTR's tussen verschillende individuen van de lengte, aangezien het aantal herhalingen verschilt in VNTR's van verschillende mensen. Kortom, het is te wijten aan allelen die zijn geërfd van hun ouders. Daarom gebruiken we VNTR's voornamelijk voor ouderlijke identificatie (erfenis) of voor persoonlijke doeleinden. Evenzo is het ook mogelijk om ze te gebruiken in genetica, forensisch onderzoek, biologisch onderzoek en DNA-vingerafdrukken. Daarom is VNTR een belangrijk hulpmiddel in de moleculaire biologie.
Figuur 01: VNTR
Bij overerving analyseren we VNTR-gegevens met behulp van twee basisprincipes: overervingsovereenkomst en identiteitsovereenkomst. Tijdens overervingsmatching moet het individu een overeenkomend allel hebben met dat van elke ouder. Tijdens identiteitsmatching moeten beide VNTR-allelen op een specifieke locatie van het genoom aanwezig zijn.
Wat is een sonde?
In de context van de moleculaire biologie is een probe een kunstmatig gesynthetiseerd DNA- of RNA-fragment met een lengte van 100 tot 1000 basen. We kunnen deze sondes radioactief labelen. Daarom gebruiken we ze bij het detecteren van doelnucleotidesequenties die complementair zijn aan de sequentie van de probe. Wanneer we sondes aan het monster toevoegen, vindt hybridisatie plaats met de complementaire sequenties of doelsequenties en maakt het ons gemakkelijk om de doelsequenties te identificeren. Omdat sondes radioactiviteit dragen, kunnen we ze gemakkelijk detecteren.
Figuur 02: Sonde
In de forensische wetenschap gebruiken we vaak sondes in DNA-profileringstechnieken zoals de detectie van korte tandem-herhalingsgebieden, polymorfismen van de lengte van restrictiefragmenten en DNA-fingerprinting.
Wat zijn de overeenkomsten tussen VNTR en sonde?
- Nucleïnezuren zijn de bouwstenen van VNTR en Probe.
- We gebruiken ze in genidentificatieprocessen.
- Ook zijn beide lengtes variabel.
- Het zijn belangrijke hulpmiddelen bij forensisch onderzoek, DNA-fingerprinting, genetica, enz.
Wat is het verschil tussen VNTR en sonde?
VNTR is een gebied van het genoom dat is georganiseerd als tandemherhalingen, terwijl een probe een korte DNA- of RNA-sequentie is die kunstmatig is gesynthetiseerd om doelsequenties in een monster te detecteren. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen VNTR en sonde. Een belangrijk verschil tussen VNTR en sonde is ook dat we, in tegenstelling tot VNTR's, de sondes radioactief kunnen labelen.
Bovendien voeren VNTR's meestal ouderlijke identificaties uit, terwijl sondes helpen bij het detecteren van doelnucleotidesequenties in DNA- of RNA-monsters die complementair zijn aan de sequentie van de sonde. Daarom is dit ook een significant verschil tussen VNTR en probe.
De volgende infographic geeft meer informatie over het verschil tussen VNTR en sonde.
Samenvatting – VNTR versus sonde
Het algemene gebruik van VNTR en sonde is in moleculaire analysetechnieken zoals forensische studies en DNA-fingerprinting. Beide bestaan uit variabele lengtes. Het belangrijkste verschil tussen VNTR en probe is echter dat een VNTR een gebied van het genoom is dat is gerangschikt met tandemherhalingen, terwijl een probe een fragment van DNA of RNA is dat radioactief kan worden gelabeld. Bovendien zijn VNTR's aanwezig in het genoom. Maar sondes worden kunstmatig gesynthetiseerd en kunnen radioactief worden gelabeld om doelnucleotidesequenties in DNA- of RNA-monsters te detecteren die complementair zijn aan de sequentie in de sonde. Dit is dus de samenvatting van het verschil tussen VNTR en sonde.
