Het belangrijkste verschil tussen CDS en cDNA is dat CDS of coderende sequentie het deel van een transcript is dat daadwerkelijk in eiwit wordt vertaald, terwijl de cDNA-sequentie een DNA-sequentie is die door reverse transcriptie van het mRNA is afgeleid.
Een gen is een nucleotidesequentie die codeert voor een eiwit. Het bestaat uit verschillende regio's als promotorregio, transcriptie-initiatieplaats, exons, startcodon, introns en stopcodon. Daarom heeft een gen zowel coderende als niet-coderende sequenties. Coderende sequenties of CDS verwijzen naar de exons en twee codons, die startcodon en stopcodon zijn. Het is de sequentie die daadwerkelijk wordt vertaald in een eiwit.cDNA is daarentegen een DNA-sequentie die is afgeleid van het mRNA door middel van reverse transcriptie.
Wat is CDS?
CDS of coderende sequentie is een deel van een gen dat daadwerkelijk wordt vertaald in een eiwit. Het bestaat uit exons en twee codons als AUG-codon en stopcodon. In tegenstelling tot cDNA bevat CDS geen twee onvertaalde regio's: 5' UTR en 3 UTR. Bovendien zijn introns niet opgenomen in CDS.
Figuur 01: Codeervolgorde
In vergelijking met het hele genoom en een individu, zijn coderende sequenties een kleine fractie. Coderende sequentie bestaat uit de noodzakelijke nucleotidesequentie om de aminozuursequentie van het eiwit te maken.
Wat is cDNA?
cDNA of complementair DNA is een DNA-sequentie gegenereerd uit mRNA-sequentie. Het wordt gesynthetiseerd door het proces dat reverse transcriptie wordt genoemd. Het enzym reverse transcriptase katalyseert de cDNA-synthese en de mRNA-sequentie fungeert als de matrijs voor de cDNA-synthese. In principe kan mRNA van eukaryote cellen worden geëxtraheerd en gezuiverd om cDNA te maken. Na het construeren van cDNA uit mRNA, kunnen ze vervolgens worden gekloneerd in een bacteriële cel om cDNA-bibliotheken te maken. cDNA-bibliotheken zijn belangrijk voor de analyse van coderende regio's, genfuncties en expressie van genen, enz.
Figuur 02: cDNA
In tegenstelling tot de coderende sequentie, bevat cDNA twee UTR's, namelijk 3' UTR en 5' UTR. Net als de coderende sequentie bevat cDNA geen introns.
Wat zijn de overeenkomsten tussen CDS en cDNA?
- CDS en cDNA zijn nucleïnezuren.
- Ze zijn gemaakt van deoxyribonucleotiden.
- Zowel CDS als CDNA bevatten geen introns, die niet-coderende regio's zijn.
- Beide bevatten de genetische code of informatie om een eiwit te produceren.
Wat is het verschil tussen CDS en cDNA?
CDS of coderende sequentie is het deel van een gen dat daadwerkelijk wordt vertaald in een eiwit. Aan de andere kant is cDNA-sequentie een DNA-sequentie die is afgeleid van het mRNA door reverse transcriptie. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen CDS en cDNA. Bovendien bestaat CDS uit exons en twee codons, die startcodon en stopcodon zijn. cDNA daarentegen bestaat uit de volledige mRNA-sequentie en twee UTR's.
Bovendien wordt cDNA-synthese kunstmatig gedaan vanuit mRNA door reverse transcriptie, terwijl CDS worden gevonden in het genomische DNA.
Onderstaande infographic toont meer vergelijkingen om het verschil tussen CDS en cDNA te onderscheiden.
Samenvatting – CDS vs cDNA
Codeersequentie en cDNA zijn twee soorten nucleotidesequenties. De coderende sequentie ligt in een gen, terwijl cDNA kunstmatig wordt gesynthetiseerd. Coderende sequentie heeft exons en twee codons, terwijl cDNA een mRNA-sequentie en twee UTR's heeft. Zowel CDS als cDNA hebben alleen de nucleotidesequenties die zich daadwerkelijk vertalen in een eiwit. Ze bevatten geen intronen. In tegenstelling tot CDS vereist het cDNA-syntheseproces reverse transcriptase-enzym. Ook kan cDNA worden omgezet in cDNA-bibliotheken. Dit vat dus het verschil tussen CDS en cDNA samen.
