Belangrijk verschil - Algemene versus specifieke transcriptiefactoren
Transcriptiefactoren zijn vereist voor RNA-polymerase om in te werken op de DNA-matrijsstreng bij het synthetiseren van mRNA. Er zijn verschillende soorten transcriptiefactoren. Deze transcriptiefactoren vormen een complex met de DNA-streng. Ze veranderen ofwel de bevestiging van de matrijsstreng of verhogen de affiniteit van het RNA-polymerase-enzym voor mRNA-synthese in het proces dat transcriptie wordt genoemd. Er zijn twee hoofdtypen transcriptiefactoren. Het zijn algemene of basale transcriptiefactoren en de specifieke transcriptiefactoren. De algemene transcriptiefactoren zijn de factoren die worden gebruikt om het pre-initiatiecomplex te vormen tijdens het transcriptieproces. Ze zijn aanwezig in bijna alle eukaryoten en in prokaryoten vormen ze een minder gecompliceerd complex. De specifieke transcriptiefactoren zijn ofwel enhancers ofwel repressors, dit zijn specifieke DNA-sequenties die het algemene transcriptieproces activeren of onderdrukken. Sommige specifieke transcriptiefactoren kunnen de DNA-sequentie zelf veranderen. Het belangrijkste verschil tussen de algemene transcriptiefactoren en de specifieke transcriptiefactoren is gebaseerd op de functionaliteit. Algemene transcriptiefactoren zijn betrokken bij de vorming van een pre-initiatiecomplex van het transcriptieproces, terwijl specifieke transcriptiefactoren deelnemen aan het activeren of onderdrukken van het transcriptieproces.
Wat zijn algemene transcriptiefactoren?
Algemene of basale transcriptiefactoren zijn de factoren die betrokken zijn bij de vorming van het initiatiecomplex tijdens transcriptie. Ze zijn essentieel voor het transcriptieproces en spelen daarom een essentiële rol bij de succesvolle transcriptie. Er zijn zes belangrijke algemene transcriptiefactoren. Zij zijn; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF en TFIIA. Ze spelen verschillende rollen tijdens de vorming van het initiatiecomplex.
- TFIID – Deze transcriptiefactor (TF) is betrokken bij het herkennen van de promotorsequentie (TATA-box).
- TFIIB – Het promotor /TFIID-complex wordt herkend door TFIIB. Dit geeft een signaal voor de binding van het belangrijkste katalyserende enzym RNA-polymerase.
- TFIIF – Deze transcriptiefactor is gebonden aan het RNA-polymerase. TFIIF neemt dus deel aan het proces door het RNA-polymerase naar de juiste locatie te rekruteren.
- TFIIE en TFIIH – De binding van deze transcriptiefactoren markeert het einde van de vorming van de pre-initiatie Binding hiervan verhoogt de efficiëntie van de vorming van het pre-initiation complex.
- TFIIA bevordert de binding van TFIID aan de TATA-box.
Figuur 01: Algemene transcriptiefactoren
De bovengenoemde algemene transcriptiefactoren zijn specifiek voor RNA-polymerase II, het type RNA-polymerase dat de mRNA-streng verlengt. Er zijn algemene transcriptiefactoren betrokken bij RNA-polymerase I en III. Algemene transcriptiefactoren kunnen ook verschillen afhankelijk van het type cel waarop het inwerkt.
Wat zijn specifieke transcriptiefactoren?
Specifieke transcriptiefactoren zijn regio's die zich ook in de DNA-sequenties bevinden. Het zijn meestal versterkers of repressoren. Specifieke transcriptiefactoren zijn de specifieke cis-werkende elementen in de matrijs-DNA-streng die transcriptie ondergaan. Activering van deze specifieke versterkers en repressoren neemt deel aan het verhogen van de affiniteit van het enzym door de oriëntatie van het DNA-molecuul te veranderen of door te werken als signaalgebieden. Specifieke transcriptiefactoren worden ook gebruikt om modificaties aan de DNA-matrijsstreng te induceren. Deze modificaties betreffen voornamelijk covalente modificaties zoals methylering. Daarbij fungeren gemethyleerde DNA-regio's als speciale versterkers of repressoren van het transcriptieproces.
Figuur 02: Specifieke transcriptiefactoren
De specifieke transcriptiefactoren zijn afhankelijk van het soort soort en worden niet algemeen in alle eukaryoten aangetroffen. Deze transcriptiefactoren worden geactiveerd door verschillende metabole omstandigheden via signa altransductieroutes. Na activering reguleren ze de expressie van het gen op transcriptioneel niveau.
Wat zijn de overeenkomsten tussen algemene en specifieke transcriptiefactoren?
- Beide factoren zijn vereist in het transcriptieproces.
- Beide factoren beïnvloeden de genexpressie van een organisme.
- Beide factoren helpen bij het reguleren van de functie van RNA-polymerase in het transcriptieproces.
- Beide factoren komen vooral voor in eukaryoten.
Wat is het verschil tussen algemene en specifieke transcriptiefactoren?
Algemene versus specifieke transcriptie |
|
| De algemene transcriptiefactoren zijn de factoren die worden gebruikt om het pre-initiatiecomplex te vormen tijdens het transcriptieproces. | De specifieke transcriptiefactoren zijn versterkers of repressoren, dit zijn specifieke DNA-sequenties die het algemene transcriptieproces activeren of onderdrukken. |
| Type molecuul | |
| Algemene transcriptiefactoren zijn gebaseerd op eiwitten. | Specifieke transcriptiefactoren zijn nucleotidesequenties. |
| Vorming | |
| Algemene transcriptiefactoren vormen het pre-initiatiecomplex tijdens de transcriptie-initiatie. | Specifieke transcriptiefactoren werken als versterkers of onderdrukkers van transcriptie. |
| Soorten | |
| Er zijn zes hoofdtypen; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE en TFIIA van algemene transcriptiefactoren. | Specifieke transcriptiefactoren worden voornamelijk gecategoriseerd als enhancers en repressors. |
Samenvatting – Algemene versus specifieke transcriptiefactoren
Transcriptiefactoren zijn essentieel voor de transcriptionele regulatie en zijn vereist voor de verhoogde efficiëntie en nauwkeurigheid van het proces. Transcriptiefactoren zijn twee hoofdtypen; Algemeen/Basaal en Specifiek. Algemene transcriptiefactoren zijn betrokken bij de vorming van het pre-initiatiecomplex tijdens transcriptie, terwijl specifieke transcriptiefactoren gebieden in het DNA zelf zijn die als versterkers of onderdrukkers werken. Algemene transcriptiefactoren zijn gebaseerd op eiwitten en zijn vereist voor alle eukaryoten. Het wordt niet veel gevarieerd en blijft als uniforme moleculen. Een specifieke transcriptiefactor kan sterk variëren en is afhankelijk van de genetische samenstelling van het individu. Dit is het verschil tussen algemene en specifieke transcriptiefactoren.
Download de PDF-versie van algemene versus specifieke transcriptiefactoren
U kunt de PDF-versie van dit artikel downloaden en gebruiken voor offline doeleinden volgens de citatienota. Download hier de pdf-versie. Verschil tussen algemene en specifieke transcriptiefactoren
