siRNA vs miRNA
RNA's zijn zeer belangrijke moleculen die helpen bij het opbouwen van het leven van organismen. Onlangs hebben wetenschappers kleine RNA's ontdekt, RNA-interferentie of RNAi genaamd, die na de transcriptie werken om genexpressie te regelen. De twee belangrijkste soorten kleine RNA's zijn micro-RNA of miRNA en klein interfererend RNA of siRNA. Deze moleculen reguleren in principe de genexpressie door het doelgen te onderdrukken. Zowel miRNA als siRNA hebben zeer vergelijkbare biogenese-routes, hoewel er enkele verschillen zijn tussen beide. De oorsprong van miRNA en siRNA zijn van dsRNA-moleculen. Volwassen miRNA's zijn structureel vergelijkbaar met siRNA-moleculen.
miRNA
Micro-RNA's of miRNA's zijn de kleine RNA-moleculen die de laatste controle in translationele genregulatie bemiddelen. Deregulering van miRNA kan leiden tot kanker en andere ziekteontwikkeling. Daarom is de juiste regulatie van informatie die is gecodeerd in het niet-coderende gebied van miRNA zeer kritisch in veel fundamentele cellulaire processen.
siRNA
siRNA's worden ook wel kort interfererend of silencing RNA genoemd en bestaan uit dubbelstrengs RNA met 20 tot 25 basenparen. De belangrijkste rol van siRNA is om te interfereren met de expressie van specifieke genen met complementaire nucleotidesequenties. siRNA bestaat uit kort dubbelstrengs RNA met gefosforyleerde 5'-uiteinden en gehydroxyleerde 3'-uiteinden met twee overhangende nucleotiden.
Wat is het verschil tussen siRNA en miRNA?
• miRNA afgeleid van specifieke genomische loci, terwijl siRNA afgeleid van mRNA, transposons, virussen of heterochromatisch DNA.
• Synthese van miRNA wordt verwerkt uit langere haarspeldtranscripten voorloper (primaire nucleaire miRNA-sequentie door RNase III-endonuclease), terwijl die van siRNA wordt verwerkt uit lange bimoleculaire RNA-duplexen.
• Elk miRNA-haarspeld-voorlopermolecuul produceert een enkele miRNA-duplex, terwijl elk siRNA-voorlopermolecuul meerdere siRNA-duplexen produceert.
• siRNA-sequenties zijn zelden geconserveerd, terwijl miRNA-sequenties goed geconserveerd zijn.
• Alle basen in siRNA dragen bij aan de doelspecificiteit, terwijl slechts de 5'-helft van miRNA bijdraagt aan de doelspecificiteit.
• miRNA bindt vaak aan het niet-vertaalde 3'-gebied van doelwittranscripten, terwijl siRNA's overal langs een doelwit-mRNA complementaire duplex vormen.
• miRNA specificeert 'hetero-silencing' terwijl siRNA wordt gebruikt voor 'auto-silencing'.
• miRNA werkt als een signaal om translatie te voorkomen, terwijl siRNA translatie fysiek verhindert.
