Belangrijk verschil - Gewortelde versus niet-gewortelde fylogenetische boom
Fylogenie is een belangrijk veld dat het leven op aarde door de tijd heen verkent. Het onthult de verbinding tussen organismen met hun voorouders en nakomelingen. De relaties tussen organismen worden schematisch weergegeven door verschillende boomachtige representaties zoals dendogram, cladogram, fenogram, phylogram, enz. Een fylogenetische boom is een vertakkend boomachtig diagram dat de fylogenetische relaties tussen organismen verklaart met de hoeveelheid evolutionaire afstand. Er zijn twee hoofdtypen fylogenetische bomen die bekend staan als geroot en niet-geworteld. Het belangrijkste verschil tussen de geroote en niet-gewortelde fylogenetische boom is dat de geroote boom de meest basale voorouder van de boom toont, terwijl de niet-gewortelde fylogenetische boom geen voorouderlijke wortel vertoont.
Wat is een gewortelde fylogenetische boom?
Een gewortelde fylogenetische boom dient als een nuttig diagram dat de evolutionaire geschiedenis laat zien. Het heeft een basale knoop die de wortel wordt genoemd, die de gemeenschappelijke voorouder van alle groepen van de boom vertegenwoordigt. De wortel van een boom wordt beschouwd als het oudste punt in de boom dat de laatste gemeenschappelijke voorouder van alle groepen in de boom vertegenwoordigt. Vandaar dat een gewortelde boom de richting van de evolutionaire tijd aangeeft. Van een enkele soort van een gewortelde boom kan de gemeenschappelijke voorouder of de soortvoorouder worden gevonden door terug te gaan naar de basale knoop. Omdat de gewortelde boom de richting van de evolutionaire tijd weergeeft, is het gemakkelijk om de oudere of nieuwere groepen te vinden. Een gewortelde boom kan worden gebruikt om de hele groepen organismen te bestuderen. Nauwkeurige beworteling van een fylogenetische boom is een belangrijke en cruciale factor, aangezien onnauwkeurige beworteling kan leiden tot verkeerde interpretaties van genetische veranderingen tussen organismen en hun richting van de evolutie.
Figuur 01: Een gewortelde fylogenetische boom
Wat is een onbewortelde fylogenetische boom?
Een onbewortelde fylogenetische boom is een fylogenetisch diagram zonder een gemeenschappelijke voorouder of een basaal knooppunt. Dit type boom geeft niet de oorsprong van de evolutie van de groepen van belang aan. Het geeft alleen de relatie tussen organismen weer, ongeacht de richting van de evolutionaire tijdlijn. Daarom is het moeilijk om de evolutionaire relaties van de groepen met betrekking tot tijd te bestuderen met behulp van een niet-gewortelde boom.
Er zijn twee manieren om een onbewortelde fylogenetische boom te rooten. Ze zijn
Het vinden van een outgroup – Dit vereist voorkennis over de relaties tussen taxa. Dan kan een taxon dat buiten de groep ligt als outgroup worden gebruikt om een gewortelde fylogenetische boom te tekenen
Het middelpunt of de afstand vinden – Het middelpunt van de twee meest afgelegen taxa in de boom kan worden aangenomen als een wortel voor de fylogenetische boom
Figuur 02: Een onbewortelde fylogenetische boom
Wat is het verschil tussen gewortelde en onbewortelde fylogenetische boom?
Gewortelde versus onbewortelde fylogenetische boom |
|
| Een gewortelde fylogenetische boom is een diagram dat de laatste gemeenschappelijke voorouder van de groepen laat zien. | Een onbewortelde fylogenetische boom toont de relaties tussen organismen zonder de gemeenschappelijke voorouder te tonen. |
| Knooppunt | |
| Het heeft een knoop (root). | Het heeft geen knoop. |
| Evolutierichting | |
| Het heeft een richting om de evolutionaire tijd aan te geven. | Het specificeert geen evolutionaire relatie. |
| Houding ten opzichte van anderen | |
| De boom maakt het mogelijk om de voorouder-afstammeling relatie tussen groepen te bepalen. | De boom staat niet toe om over voorouder-afstammeling relatie te praten. |
Samenvatting – Gewortelde versus onbewortelde fylogenetische boom
Een fylogenetische boom vertegenwoordigt de evolutionaire paden en verbindingen tussen organismen met behulp van vertakte boomachtige diagrammen. Fylogenetische haarlok kan geworteld of onbeworteld zijn. Een gewortelde boom heeft een knoop aan de basis, die de gemeenschappelijke voorouder vertegenwoordigt die alle belangengroepen met elkaar verbindt. Een onbewortelde boom toont de relaties tussen organismen. Het geeft echter niet de gemeenschappelijke voorouder weer die alle groepen delen. Dit is het verschil tussen een gewortelde en een niet-gewortelde fylogenetische boom.
