Belangrijk verschil – Herhaald DNA versus satelliet-DNA
Genomisch DNA bestaat voornamelijk uit coderend DNA en niet-coderend DNA. Coderende sequenties staan bekend als genen. Duizenden genen bevinden zich op chromosomen. Repetitief DNA, introns en regulerende sequenties worden beschouwd als niet-coderend DNA in het genoom. Repetitief DNA zijn de nucleotidesequenties die zich steeds weer herhalen in het genoom van de organismen. Repetitief DNA is goed voor een aanzienlijk deel van het genomische DNA en is onderverdeeld in drie hoofdtypen, genaamd tandemherhalingen, terminale herhalingen en afgewisselde herhalingen. Tandemherhalingen zijn zeer repetitief in het genoom. Een type tandemherhalingen is satelliet-DNA. Het belangrijkste verschil tussen repetitief DNA en satelliet-DNA is dat repetitief DNA de herhaalde sequenties van DNA in het genoom zijn, terwijl satelliet-DNA een type repetitief DNA is dat sterk wordt herhaald en zich meestal in het heterochromatische gebied rond het centromeer bevindt.
Wat is repetitief DNA?
Repetitief DNA heeft steeds weer herhaalde nucleotidesequenties. Repetitief DNA is ook bekend als repetitieve elementen of herhalingen. Repetitief DNA beslaat een aanzienlijk deel van het totale genoom van veel organismen. Het menselijk genoom bevat meer dan een tweederde reeks repetitief DNA. Deze coderen niet voor eiwitten en behoren tot de categorie van niet-coderend DNA van het genoom.
Er zijn drie hoofdtypen repetitief DNA genaamd terminale herhalingen, tandemherhalingen en afgewisselde herhalingen. Tandemherhalingen zijn de zeer herhaalde reeksen die naast elkaar liggen. Er zijn drie soorten tandemherhalingen die satelliet-DNA, minisatelliet-DNA en microsatelliet-DNA worden genoemd. Afgewisseld repetitief DNA is een repetitieve sequentie die door het genoom is verspreid als afzonderlijke eenheden met unieke flankerende sequenties. Er zijn twee soorten afgewisseld DNA genaamd transposons en retrotransposons. Ze ontstaan vanwege het vermogen van transpositie binnen het genoom. Retrotransposons behoren tot de transponeerbare elementen van klasse 1 en volgen het kopieer- en plakmechanisme om in het genoom te integreren. Transposons behoren tot klasse 2 transponeerbare elementen omdat ze het knip- en plakmechanisme volgen om langs het genoom te bewegen.
Hoewel repetitief DNA niet is gecodeerd voor eiwitten, zijn ze belangrijk voor verschillende functies in het genoom. Repetitief DNA is essentieel om de expressie van unieke coderende sequenties te formatteren en om extra functies te bieden die nodig zijn voor genoomreplicatie en nauwkeurige transmissie naar dochtercellen, enz. Repetitief DNA biedt ook een aanzienlijk deel van de steiger- of matrixaanhechtingsgebieden, wat de noodzaak aantoont bij het organiseren van het genoom van organismen.
Wat is satelliet-DNA?
Satelliet-DNA is een type repetitief DNA dat in hoge mate wordt herhaald. Ze behoren tot de categorie van repetitief DNA die tandemherhalingen worden genoemd. Satelliet-DNA wordt tandem herhaald en bevindt zich in de centromeer- en telomeerregio's van chromosomen. Een korte zich herhalende eenheid van satelliet-DNA varieert van 5 tot 300 basenparen, afhankelijk van de soort. Ze herhalen zich normaal gesproken 105 tot 106 keer in het genoom. In het zoogdiergenoom is satelliet-DNA verantwoordelijk voor een fractie van 10 – 20%.
Satelliet-DNA codeert niet voor eiwitten en draagt geen functionele genetische informatie over. Ze dragen bij aan de chromosomale organisatie omdat ze het hoofdbestanddeel van de functionele centromeren dienen en als het belangrijkste structurele bestanddeel van heterochromatine.
Satelliet-DNA verschilt in dichtheid met de meeste DNA. Daarom geeft het een aparte band tijdens ultracentrifugatie. Er zijn verschillende soorten satelliet-DNA bekend als alphoid-DNA, bèta, satelliet 1, satelliet 2, satelliet 3 enz.
Figuur 01: repetitief DNA en satelliet-DNA
Wat is het verschil tussen repetitief DNA en satelliet-DNA?
Repetitief DNA versus satelliet-DNA |
|
| Repetitief DNA zijn de nucleotidesequenties die vele malen worden herhaald in het genoom van organismen. | Satelliet-DNA is een type repetitief DNA dat miljoenen keren in het genoom wordt herhaald. |
| Typen | |
| Er zijn drie hoofdtypen, zoals terminale herhalingen, tandemherhalingen en afgewisselde herhalingen. | Satelliet-DNA wordt ingedeeld in verschillende typen, zoals alfoïde, bèta, saterliet1, 2 en 3, enz. |
| Locatie | |
| Repetitief DNA bevindt zich door het hele genoom. | Satelliet-DNA bevindt zich in centromeer- en telomeergebieden van het chromosoom. |
Samenvatting – Herhaald DNA versus satelliet-DNA
Genomen zijn georganiseerd in verschillende soorten DNA. Coderende sequenties onder hen worden opgeslagen met genetische informatie om eiwitten te synthetiseren. Andere niet-coderende sequenties bieden structurele en aanvullende functies voor DNA-replicatie, chromosoomstructuurbehoud, enz. Repetitief DNA is een type niet-coderend DNA dat steeds weer wordt herhaald binnen het genoom. Repetitief DNA heeft verschillende typen en satelliet-DNA, dat zich in de centromeer- en telomeergebieden van de chromosomen bevindt, is er een van. Dit is het verschil tussen repetitief DNA en satelliet-DNA.
Download PDF-versie van repetitief DNA versus satelliet-DNA
U kunt de PDF-versie van dit artikel downloaden en gebruiken voor offline doeleinden volgens de citatienotities. Download hier de PDF-versie. Verschil tussen repetitief DNA en satelliet-DNA - PDF.
