Het belangrijkste verschil tussen insertie- en vervangingsvectoren is dat de insertievector het vermogen heeft om matige lengtes vreemd DNA in te voegen, terwijl de vervangingsvector het vermogen heeft om grotere lengtes vreemd DNA te accommoderen.
Faagvectoren zijn de bacteriofagen die worden gebruikt voor klonen. Er zijn twee soorten faagvectoren; ze zijn invoegvector en vervangingsvector. Ook bestaan alle faagvectoren uit niet-essentiële genen. Deze genen moeten echter uit fagen worden verwijderd om nieuwe vreemde DNA-inserties mogelijk te maken.
Wat is een invoegvector?
Allereerst is de insertievector de eenvoudigste vorm van lambda-kloneringsvectoren. In feite is het een type faagvector met een unieke restrictieplaats die in het vectorgenoom is geïntroduceerd op de positie van optioneel DNA. Verder blijft het faag-DNA achter zonder verwijdering. Dit niet-verwijderen van het faag-DNA beperkt de grootte van de inserts (vreemd DNA) die in de vector moeten worden gekloneerd. Bovendien zijn deze vectoren bruikbaar bij cDNA-klonering en expressie. GT10, GT11 en Zap zijn voorbeelden van deze vector.
Figuur 01: Lambda-faag
Invoegvector bestaat uit een enkele herkenningssite. De primaire functie van deze vector is het ontwikkelen van cDNA-bibliotheken die zijn afgeleid van eukaryote mRNA-sequenties. Bovendien kan het alleen lengtes vreemd DNA accommoderen tussen 05-11 kb. Het heeft ook een unieke splitsingsplaats voor het inbrengen van vreemd DNA.
Wat zijn vervangende vectoren?
Vervangingsvector of substitutievector is een type faagvector die is ontwikkeld door de verwijdering van een middelste 'vullerfragment'-gebied van faag-DNA. Het gewenste vreemde DNA-insert vervangt het faag-DNA.
Figuur 02: Vervangingsvector
Vervangende vectoren zijn belangrijk bij het creëren van genomische bibliotheken zoals EMBL4 en Charon40. Deze vectoren kunnen een grotere lengte vreemd DNA accommoderen, variërend tussen 08-24kb lengtes. Het vulgebied bestaat ook uit een gen dat de faagvector niet-levensvatbaar maakt in een bacteriële gastheer.
Wat zijn de overeenkomsten tussen invoeg- en vervangingsvectoren?
- Invoeg- en vervangingsvectoren zijn faagvectoren.
- Beide vectoren zijn geschikt voor vreemde DNA-inserts.
- Ze zijn allebei nuttig bij het maken van DNA-bibliotheken.
Wat is het verschil tussen invoeg- en vervangingsvectoren?
Invoeging versus vervangende vectoren |
|
| Insertievector is een type faagvector met een restrictieplaats die in het faaggenoom is geïntroduceerd op de plaats van optioneel DNA. | Vervangingsvector is een type faagvector die is ontwikkeld door de verwijdering van een middelste 'vullerfragment'-gebied van faag-DNA |
| Grootte van invoegfragmenten | |
| 05-11 kb lengte | 08-24 kb lengte |
| Opvulfragment | |
| Geen opvulfragment | Filler fragment wordt vervangen door een vreemde insert |
| Functie | |
| Belangrijk om cDNA-bibliotheken te maken | Belangrijk bij het maken van genoombibliotheken |
| Voorbeelden | |
| GT10, GT11 en Zap zijn voorbeelden | EMBL4 en Charon40 zijn voorbeelden |
| splitsingsplaats | |
| Er is een unieke splitsingsplaats aanwezig | De splitsingsplaats bevat genen die niet essentieel zijn voor de lytische cyclus |
Samenvatting – Invoeging versus vervangende vectoren
Zowel insertie- als vervangingsvectoren zijn twee soorten faagvectoren. Beide vectoren hebben restrictieplaatsen die de accommodatie van nieuwe vreemde DNA-inserts vergemakkelijken. Insertievectoren zijn belangrijk bij het creëren van cDNA-bibliotheken, terwijl vervangingsvectoren belangrijk zijn bij het creëren van genomische bibliotheken. Bovendien zijn insertievectoren geschikt voor DNA-inserts met een gemiddelde lengte. Maar vervangingsvectoren kunnen grotere lengtes van vreemde DNA-inserties accommoderen. Over het algemeen is dit het belangrijkste verschil tussen invoeg- en vervangingsvectoren.
