Het belangrijkste verschil tussen maximale spaarzaamheid en maximale waarschijnlijkheid hangt af van de methode die wordt gebruikt bij het ontwikkelen van de fylogenetische boom. Maximale spaarzaamheid richt zich op het minimaliseren van de totale karaktertoestanden tijdens de fylogenetische boomconstructie, terwijl de maximale waarschijnlijkheid een statistische benadering is bij het tekenen van de fylogenetische boom, afhankelijk van de waarschijnlijkheid tussen genetische gegevens.
Fylogenie is de nieuwe benadering van classificatie en nomenclatuur van organismen. Fylogenie is gebaseerd op genetische gegevens en evolutionaire relaties. De genetische gegevens zijn het resultaat van DNA-sequencing. In de fylogenie vindt classificatie van organismen plaats op basis van de gemeenschappelijke voorouder. Maximale spaarzaamheid en maximale waarschijnlijkheid van een fylogenetische relatie verhogen de nauwkeurigheid en betrouwbaarheid van een fylogenetische boom.
Wat is maximale spaarzaamheid?
In de techniek van maximale spaarzaamheid vindt het minimaliseren van de totale karaktertoestandsveranderingen plaats tijdens de fylogenetische analyse. Fylogenetisch is een tak van de biologie die zich bezighoudt met het bestuderen van evolutionaire relaties. Een fylogenetische boom is een boom die de evolutionaire relaties toont op basis van een gemeenschappelijke voorouder. Dus bij het tekenen van een fylogenetische boom met behulp van het concept van maximale spaarzaamheid, wordt de hoeveelheid parallelle evolutie geminimaliseerd. Daarom zal maximale spaarzaamheid de boom veel sneller genereren dan andere methoden. Het is omdat alleen de belangrijkste onderscheidende kenmerken in maximale spaarzaamheid worden overwogen.
Figuur 01: Maximale spaarzaamheid
Bij het tekenen van een maximale spaarzame boom, is de boom altijd de kortst mogelijke boom met het minimum aantal taxa. De betrouwbaarheid van een maximale spaarzame boom is echter zeer hoog. De statistische consistentie en de nauwkeurigheid van de fylogenetische relatie op basis van maximale spaarzaamheid zal variëren. Bovendien zijn er complexe algoritmen die de maximale spaarzaamheid van een fylogenetische relatie analyseren.
Wat is de maximale kans?
Maximale waarschijnlijkheid is een van de meest gebruikte statistische methoden om fylogenetische relaties te analyseren. De methode analyseert de fylogenie op basis van het waarschijnlijkheidsmodel. Verder houdt deze methode rekening met zowel het gemiddelde als de variantie. In de fylogenie wordt dus de maximale waarschijnlijkheid verkregen op basis van de gegeven genetische gegevens van een bepaald organisme.
Figuur 02: Maximale waarschijnlijkheid
Er zijn zowel voor- als nadelen aan het gebruik van de statistische methode van maximale waarschijnlijkheid. De methode is zeer geschikt bij het analyseren van een eenvoudige dataset met genetische informatie. Wanneer de mate van variantie tussen de genetische gegevens lager is, zijn de maximale waarschijnlijkheidsscores betrouwbaar. De resultaten gegenereerd door maximale waarschijnlijkheid bevestigen verder de maximale spaarzaamheidscores van een bepaalde fylogenetische relatie. Daarom fungeert maximale waarschijnlijkheidsanalyse als een bevestigende test.
In vergelijking met de bovengenoemde voordelen is deze methode een langzaam en intensief proces. Bovendien is de foutoutput hoog als er geen enkele dataset is. Het maakt dus ook de reproduceerbaarheid van de resultaten moeilijker door de schatting van de maximale waarschijnlijkheid.
Wat zijn de overeenkomsten tussen maximale spaarzaamheid en maximale kans?
- Maximale spaarzaamheid en maximale waarschijnlijkheid zijn twee benaderingen die een belangrijke rol spelen in de fylogenie.
- Beide technieken geven de relatie van een organisme tot zijn voorouder weer op basis van de beschikbare genetische gegevens.
- Fylogenetische bomen kunnen worden geïnterpreteerd met zowel maximale spaarzaamheid als maximale waarschijnlijkheid.
- Bij beide technieken zijn de genetische gegevens afhankelijk van DNA-sequencing of RNA-sequencing.
- Beide methoden zijn belangrijk bij het genereren van fylogenetische bomen.
Wat is het verschil tussen maximale spaarzaamheid en maximale kans?
Zowel maximale spaarzaamheid als maximale waarschijnlijkheid zijn twee verschillende benaderingen bij het interpreteren van een fylogenetische boom. Maximale spaarzaamheid gelooft in het analyseren van enkele kenmerken en het minimaliseren van de karakterveranderingen van organisme tot organisme. De maximale waarschijnlijkheidsmethode daarentegen houdt rekening met zowel het gemiddelde als de variantie en verkrijgt de maximale waarschijnlijkheid op de gegeven genetische gegevens van een bepaald organisme. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen maximale spaarzaamheid en maximale waarschijnlijkheid.
Bovendien is de betrouwbaarheid van maximale spaarzaamheid alleen niet voldoende om een conclusie te trekken. Maar de maximale waarschijnlijkheidsmethode fungeert als een bevestigende test van de resultaten van maximale spaarzaamheid. Daarom moeten conclusies worden getrokken met zowel maximale spaarzaamheid als maximale waarschijnlijkheid.
De onderstaande infographic vat het verschil samen tussen maximale spaarzaamheid en maximale waarschijnlijkheid.
Samenvatting – Maximale spaarzaamheid versus maximale kans
Fylogenie speelt een belangrijke rol bij het afleiden van evolutionaire relaties door fylogenetische bomen te bouwen. Maximale spaarzaamheid is de techniek van het construeren van een boom met zo min mogelijk verandering van de karakterstatus. Daarentegen is de maximale waarschijnlijkheid van een fylogenetische boom afhankelijk van het gebruik van de maximale overeenkomst tussen genetische gegevens. De gegevens voor beide analyses zijn afkomstig uit de DNA- of RNA-sequentiegegevens. De betrouwbaarheid en nauwkeurigheid zijn hoog wanneer de boomconstructie plaatsvindt met behulp van beide technieken. Dit vat dus het verschil samen tussen maximale spaarzaamheid en maximale waarschijnlijkheid.
