Het belangrijkste verschil tussen DNA en eiwitmicroarray is dat DNA-microarray een verzameling microscopisch kleine DNA-vlekken is die aan een vast oppervlak zijn bevestigd, zoals een glasplaatje, terwijl eiwitmicroarray een rangschikking is van gezuiverde eiwitten op een vast oppervlak zoals een glas schuif.
Microarray is een laboratorium op een chip (LOC) apparaat. Het is een miniatuur, multiplex, parallel verwerkings- en detectieapparaat. Het is ook een tweedimensionale array op een vast oppervlak, zoals een glasplaatje of een dunne-filmcel van silicium. Een microarray analyseert een grote hoeveelheid biologisch materiaal met behulp van high-throughput screening. De eerste microarray was de antilichaamchip die in 1983 door Tse Wen Chang werd geïntroduceerd. De eerste genchip werd in 1995 geïntroduceerd door Ron Davis en Pat Brown aan de Stanford University. Daarom zijn DNA- en eiwitmicroarray twee soorten microarray-apparaten.
Wat is DNA Microarray?
DNA-microarray is een verzameling microscopisch kleine DNA-vlekken die aan een vast oppervlak zijn bevestigd, zoals een glasplaatje. Wetenschappers gebruiken DNA-microarray om de expressie van een groot aantal genen tegelijk te meten. Het wordt ook gebruikt om meerdere regio's van een genoom te genotyperen. De DNA-microarray wordt bereid met behulp van robotmachines. Deze machines rangschikken honderden of duizenden gensequenties (sondes) op een enkel microscopisch objectglaasje.
Figuur 01: DNA-microarray
In een DNA-microarray bevat elke DNA-spot picomol (10−12 mol) van een specifieke DNA-sequentie. Deze DNA-sequenties worden ook wel probes of reporters genoemd. Deze probes zijn een kort stukje DNA van een gen of ander DNA-element. Ze kunnen hybridiseren met cDNA of CRNA in een monster onder zeer stringente omstandigheden. De fluorescent gelabelde monstersequenties die aan probes binden, genereren signalen die afhankelijk zijn van hybridisatieomstandigheden zoals temperatuur. Daarom kan deze methode worden gebruikt om de relatieve overvloed aan nucleïnezuursequenties in het monster te bepalen. Bovendien wordt de DNA-microarraytechniek veel toegepast in genexpressiestudies, vergelijkende genomische studies, het controleren van besmetting van voedsel- of celculturen door pathogenen, het evalueren van genmutaties, het identificeren van kandidaat-geneesmiddelen, genetische koppelingsanalyse, enz.
Wat is Protein Microarray?
Protein microarray is een rangschikking van gezuiverde eiwitten op een vast oppervlak zoals een glasplaatje. Het is een methode die wordt gebruikt om de interacties en activiteiten van eiwitten te detecteren. Het wordt ook gebruikt om op grote schaal de functies van eiwitten te bepalen. Het belangrijkste voordeel van eiwitmicroarray is dat een groot aantal eiwitten parallel kan worden gevolgd. Eiwitmicroarray is een chip die bestaat uit een steunoppervlak zoals een glasplaatje, een nitrocellulosemembraan, een korrel of een microtiterplaat. De capture-eiwitten (antilichamen, antigenen) zijn aan dit vaste oppervlak gebonden. De probe-moleculen die gewoonlijk met een fluorescerende kleurstof zijn gelabeld, worden later aan de array toegevoegd. De hybridisatie tussen probe en geïmmobiliseerde eiwitten zendt een fluorescerend signaal uit dat kan worden gedetecteerd door een laserscanner.
Figuur 02: Protein Microarray
De eerste eiwitarray is een antilichaammicroarray (antilichaammatrix) die in 1983 werd geïntroduceerd. Eiwitmicroarrays zijn snel, geautomatiseerd, zeer gevoelig en economisch. Ze verbruiken ook slechts een kleine hoeveelheid monsters en reagentia. Bovendien worden eiwitmicroarrays op grote schaal toegepast bij ziektediagnose, eiwitfunctionele analyse, antilichaamkarakterisering en behandelingsontwikkeling.
Wat zijn de overeenkomsten tussen DNA en eiwitmicroarray?
- DNA en eiwit-microarray zijn twee soorten microarray-apparaten.
- Beide apparaten zijn gebaseerd op het hybridisatieprincipe.
- Beide apparaten maken gebruik van sondes.
- Ze gebruiken ook fluorescentiesignalen voor het detecteren van hybridisatie.
- Ze zijn allebei enorm nuttig bij de diagnose van ziekten in de geneeskunde.
Wat is het verschil tussen DNA en eiwitmicroarray?
DNA-microarray is een verzameling microscopisch kleine DNA-vlekken die aan een vast oppervlak zijn bevestigd, zoals een glasplaatje. Eiwitmicroarray daarentegen is een rangschikking van gezuiverde eiwitten op een vast oppervlak zoals een glasplaatje. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen DNA- en eiwitmicroarray. Bovendien zijn in een DNA-microarray het monster en de probe DNA-sequenties. Aan de andere kant, in eiwitmicroarray, zijn het monster en de probe eiwitten.
De volgende infographic presenteert de verschillen tussen DNA en eiwit-microarray in tabelvorm.
Samenvatting – DNA versus eiwitmicroarray
Een microarray is een high-throughput en multiplex lab-on-a-chip. Het is gemaakt op basis van het hybridisatieprincipe. DNA- en eiwitmicroarray zijn twee soorten microarray-apparaten. DNA-microarray is een verzameling microscopisch kleine DNA-vlekken die aan een vast oppervlak zijn bevestigd, zoals een glasplaatje. Aan de andere kant is eiwitmicroarray een rangschikking van gezuiverde eiwitten op een vast oppervlak zoals een glasplaatje. Dit is dus de samenvatting van het verschil tussen DNA en eiwit-microarray.
