Het belangrijkste verschil tussen isoschizomeren en isocaudomeren is dat isoschizomeren dezelfde restrictie- of herkenningsplaats herkennen en splitsen, terwijl isocaudomeren enigszins verschillende restrictieplaatsen herkennen en op dezelfde plaats splitsen.
Restrictie-enzymen of restrictie-endonucleasen zijn een soort nucleasen die dubbelstrengs DNA splitsen. Ze kunnen specifieke sequenties herkennen die restrictieplaatsen worden genoemd en die palindroom van oorsprong zijn. Bacteriën produceren restrictie-enzymen tegen vreemde pathogenen, vooral tegen virussen. Het is een vorm van afweermechanisme dat door bacteriën wordt getoond. Afhankelijk van de structuur van het enzym en de aard van de sneden, zijn er drie soorten restrictie-enzymen als type I restrictie-enzymen, type II restrictie-enzymen en type II restrictie-enzymen. Bovendien zijn er, afhankelijk van de biochemische activiteit en de bron van isolatie, drie soorten restrictie-enzymen als isoschizomeren, neoschizomeren en isocaudomeren.
Wat zijn isoschizomeren?
Isochizomeren zijn een type restrictie-enzym dat uit verschillende bronnen komt, maar dezelfde restrictieplaats in DNA herkent en splitst. Daarom hebben twee isoschizomeren dezelfde herkenningsplaats. Ze splitsen op dezelfde plaats, dus ze zijn specifiek voor dezelfde herkenningssequentie. De restrictie-enzymen SphI en BbuI zijn bijvoorbeeld twee isoschizomeren die herkennen en splitsen bij CGTAC/G.
Figuur 01: Restrictie-enzym
Een ander paar isoschizomeren is HpaII en MspI. Ze herkennen allebei de sequentie 5'-CCGG-3' en klieven het DNA. Bovendien zijn BspEI en Acc III ook isoschizomeren die respectievelijk van een Bacillus-soort en Acinetobacter calcoaceticus zijn. Isolatie van isoschizomeren kan worden gedaan van verschillende bacteriën. Omdat ze afkomstig zijn van verschillende bacteriën, kunnen hun restrictievoorwaarden van elkaar verschillen.
Wat zijn isocaudomeren?
Isocaudomeren zijn een type restrictie-enzym dat enigszins verschillende sequenties herkent, maar ze splitsen op dezelfde plaats om dezelfde uiteinden te produceren. Isocaudomeren komen ook van verschillende bacteriën. Sau3a en BamHI zijn een paar isocaudomeren. Ze produceren 5'-GATC-3' plakkerig uiteinde na splitsing van dezelfde site. Een ander paar isocaudomeren is NcoI van Nocardia corallina en PagI van Pseudomonas alcaligenes. Deze twee enzymen binden ook op verschillende herkenningssequenties, maar knippen op dezelfde plaats en produceren dezelfde plakkerige uiteinden. Daarom zijn het produceren van snijuiteinden compatibel met elkaar en kunnen ze aan elkaar worden geligeerd. XhoI, PspXI en SalI zijn ook isocaudomeren.
Wat zijn de overeenkomsten tussen isoschizomeren en isocaudomeren?
- Isochizomeren en isocaudomeren zijn twee soorten restrictie-enzymen.
- Twee isoschizomeren hebben dezelfde verteringsplaats, vergelijkbaar met twee isocaudomeren die dezelfde verteringsplaats hebben.
- Ze zijn van prokaryotische oorsprong.
- Beide hebben een restrictieherkenningsplaats en een verteringsplaats.
- Ze produceren uiteinden die compatibel zijn met elkaar.
- Bovendien zijn deze enzymen nuttige hulpmiddelen in de recombinant-DNA-technologie.
Wat is het verschil tussen isoschizomeren en isocaudomeren?
Isochizomeren zijn restrictie-enzymen die dezelfde DNA-sequentie herkennen en op dezelfde restrictieplaats splitsen, terwijl isocaudomeren restrictie-enzymen zijn die enigszins verschillende DNA-sequenties herkennen, maar dezelfde plakkerige uiteinden produceren door op dezelfde plaats te knippen. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen isoschizomeren en isocaudomeren.
De onderstaande infographic geeft het verschil weer tussen isoschizomeren en isocaudomeren.
Samenvatting – Isoschizomers vs Isocaudomers
Isochizomeren zijn restrictie-enzymen die dezelfde DNA-sequentie herkennen en op dezelfde plaats splitsen. Aan de andere kant zijn isocaudomeren restrictie-enzymen die de enigszins verschillende sequenties herkennen en op dezelfde plaats splitsen en dezelfde uiteinden produceren. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen isoschizomeren en isocaudomeren. SphI, BbuI, HpaII en MspI zijn verschillende voorbeelden van isoschizomeren, terwijl Sau3a en BamHI twee voorbeelden zijn van isocaudomeren. Zowel isoschizomeren als isocaudomeren worden van nature geproduceerd door bacteriën.
