Het belangrijkste verschil tussen sigmafactor en rho-factor is dat sigmafactor een eiwit is dat nodig is voor de initiatie van transcriptie in bacteriën, terwijl rho-factor een eiwit is dat nodig is voor de beëindiging van transcriptie in bacteriën.
Sigma-factor en rho-factor zijn twee belangrijke factoren voor bacteriële transcriptie. Bacteriële transcriptie is een proces waarbij een stukje bacterieel DNA wordt gekopieerd naar een nieuw gemaakte mRNA-streng (messenger-RNA). Dit proces wordt gekatalyseerd door een enzym dat bekend staat als RNA-polymerase. Bacteriën zijn sterk afhankelijk van transcriptie en translatie om goed op hun omgeving te kunnen reageren. Het bacteriële RNA-polymerase bestaat uit een kern en een holo-enzymstructuur. De kern bevat de subeenheden β, β′, α en 2ω, terwijl het holoenzym de sigmafactor bevat. Bovendien is een aanvullende factor van RNA-polymerase, bekend als de rho-factor, ook erg belangrijk voor bacteriële transcriptie.
Wat is Sigma-factor?
Sigmafactor of specificiteitsfactor is een eiwit dat nodig is voor de initiatie van transcriptie in bacteriën. Het is een bacteriële transcriptie-initiatiefactor. Deze factor maakt de binding mogelijk van RNA-polymerase-enzym aan een specifiek DNA-gebied dat het promotorgebied wordt genoemd tijdens transcriptie. Sigma-factor is normaal gesproken homoloog aan archaeale transcriptiefactor B en aan eukaryote transcriptiefactor TF11B. Bovendien varieert de specifieke sigmafactor van een bepaald gen afhankelijk van het gen en omgevingssignalen. De promotors worden geselecteerd door RNA-polymerase, afhankelijk van de sigmafactor die ermee is geassocieerd.
Figuur 01: Sigma-factor
De sigmafactor kan ook worden gevonden in de chloroplast van planten als onderdeel van het door plastide gecodeerde polymerase (PEP). De sigmafactor en RNA-polymerase samen staat bekend als RNA-polymerase-holo-enzym. Het molecuulgewicht van de sigmafactor is ongeveer 70 kDa. Na de initiatie van transcriptie dissocieert de sigmafactor van het complex. Dan gaat de RNA-polymerase door met elongatie totdat de transcriptie stopt.
Wat is de Rho-factor?
Rho-factor is een prokaryotisch eiwit dat betrokken is bij de beëindiging van transcriptie. Rho-factor bindt gewoonlijk aan de pauzeplaats van de transcriptieterminator. Deze plaats is een blootgesteld gebied van het enkelstrengs RNA nabij het open leesraam bij cytosinerijke guaninearme sequenties. Het is een essentieel transcriptie-eiwit in prokaryoten. In Escherichia coli is de rho-factor ongeveer 274,6 kDa hexameer van identieke subeenheden. Elke subeenheid heeft een RNA-bindend domein en een ATP-hydrolysedomein. Bovendien is de functie van de rho-factor helicase-activiteit.
Figuur 02: Rho-factor
Rho-factor bindt aan RNA-molecuul en gebruikt vervolgens zijn ATPase-activiteit om energie te leveren om RNA-moleculen te verplaatsen. Rho-factor voert translocatie uit totdat het het RNA-DNA-helixgebied bereikt, waar het de hybride (RNA-DNA) duplexstructuur afwikkelt. Dit proces pauzeert RNA-polymerase op de terminatieplaats en beëindigt het transcriptieproces.
Wat zijn de overeenkomsten tussen Sigma-factor en Rho-factor?
- Sigma-factor en rho-factor zijn twee belangrijke factoren voor bacteriële transcriptie.
- Beide zijn alleen aanwezig in prokaryoten.
- Het zijn eiwitten die zijn opgebouwd uit aminozuren.
- Beide zijn nucleïnezuurbindende eiwitten.
- Prokaryoten zijn sterk afhankelijk van deze factoren om mRNA te genereren dat eigenaardige eiwitten kan maken en hen kan helpen specifiek op hun omgeving te reageren.
Wat is het verschil tussen Sigma-factor en Rho-factor?
Sigma-factor is een eiwit dat nodig is voor het initiëren van transcriptie in bacteriën, terwijl rho-factor een eiwit is dat nodig is voor het beëindigen van transcriptie in bacteriën. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen sigmafactor en rho-factor. Verder is de sigmafactor een DNA-bindend eiwit, terwijl de rho-factor een RNA-bindend eiwit is.
De onderstaande infographic presenteert de verschillen tussen sigma-factor en rho-factor in tabelvorm voor vergelijking naast elkaar.
Samenvatting – Sigma-factor vs Rho-factor
Transcriptie is het proces waarbij de informatie in het DNA wordt gekopieerd naar een nieuw molecuul dat mRNA (messenger-RNA) wordt genoemd. Dit m-RNA is uiteindelijk betrokken bij de productie van een specifiek eiwit. Sigma-factor en rho-factor zijn twee belangrijke factoren voor bacteriële transcriptie. Het zijn eiwitten. Sigma-factor neemt deel aan de initiatie van transcriptie in bacteriën. Rho-factor is verantwoordelijk voor de beëindiging van transcriptie in bacteriën. Dit is dus de samenvatting van het verschil tussen sigmafactor en rho-factor.
