Belangrijk verschil - Eukaryotische versus prokaryotische promotors
Transcriptie is het proces van het omzetten van de genetische informatie die is opgeslagen in de coderende DNA-sequentie in mRNA-sequentie. Een specifiek DNA-gebied aan het 5'-uiteinde van de transcriptie-eenheid initieert dit proces. Dat gebied staat bekend als het promotorgebied. Deze promotors worden typisch gevonden naast de transcriptiestartplaats. De lengte van een promotor varieert van 100 bp tot 1000 bp. Promotors zijn verschillend afhankelijk van het type organisme. Eukaryotische en prokaryotische promotors zijn verschillend van elkaar. In prokaryoten worden slechts drie typen promotorsequenties gevonden, namelijk -10 promotors, -35 promotor en stroomopwaartse elementen. In eukaryoten zijn er veel verschillende promotorelementen, zoals TATA-box, initiatorelementen, GC-box, CAAT-box, enz. Dit is het belangrijkste verschil tussen eukaryote en prokaryotische promotors.
Wat zijn eukaryote promotors?
Drie hoofdporties; kernpromotor, proximale promotor en distale promotor, vormen samen een promotor. In de context van eukaryoten zijn er veel aantallen promotorelementen gevonden die zeer geavanceerd en diverser zijn dan promotors. Er is ontdekt dat, vanwege deze complexiteit van de eukaryote promotors, het DNA het vermogen heeft om zichzelf terug te vouwen. Dit verklaart ook het feit dat het effect van veel regulerende sequenties plaatsvindt, ook al zijn ze vele kilobasen verwijderd van de plaats van transcriptie. Deze eukaryote promotors hebben het vermogen om een breed scala aan DNA-sequenties te overspannen.
Figuur 01: Eukaryote promotor
Voorbeelden voor sommige eukaryote promotors zijn Pribnow-box (TATA-box), GC-box, CAAT-box enz. In de context van TATA-box is het een sequentie van 5' – TATAA -3' die aanwezig is in de kern promotor regio. Aan de TATA-box zijn transcriptiefactor-eiwitten en histon-eiwitten gebonden. De binding van transcriptiefactor-eiwitten aan de TATA-box helpt bij de binding van RNA-polymerase, wat vervolgens resulteert in de vorming van een transcriptiecomplex. In eenvoudige bewoordingen zal de binding van deze eiwitten het transcriptieproces aansturen. Dit proces wordt geremd wanneer histon-eiwitten aan de TATA-box worden gebonden. Daarom is de TATA-box een belangrijk promotorelement dat betrokken is bij de regulering van de snelheid van eukaryote transcriptie.
Wat zijn prokaryotische promotors?
In prokaryotische organismen wordt de promotor die betrokken is bij transcriptie geïdentificeerd door de bijbehorende factor die sigmafactor wordt genoemd. Sigma-factoren zijn uniek voor verschillende promotorsequenties. Daarom wordt gezegd dat elke enkele sigmafactor een enkele kernpromotorsequentie zou herkennen. Dit is een unieke eigenschap die aanwezig is in het prokaryotische transcriptieproces. Zowel RNA-polymerase als de sigmafactor identificeren samen het juiste promotorgebied en vormen het transcriptiecomplex.
De prokaryotische promotor bevat slechts drie soorten promotorelementen. De geringere betrokkenheid van promotorelementen bij prokaryoten is de belangrijkste reden waarom hun transcriptieproces minder geavanceerd is in vergelijking met eukaryote transcriptie waarbij een groter aantal promotorsequenties betrokken is. Van de drie promotorelementen van prokaryoten zijn er twee belangrijke twee korte DNA-sequenties. Deze sequenties zijn geclassificeerd op basis van hun locatie. Dit zijn -10 promoters of element (dat 10 bp stroomopwaarts van de transcriptiestartplaats aanwezig is), -35 promoters of element (dat 35 bp stroomopwaarts van de transcriptiestartplaats aanwezig is).
Figuur 02: Prokaryote promotor
De -10-promotor is equivalent aan de eukaryote TATA-box of Pribnow-box en is een essentieel onderdeel voor de initiatie van transcriptie in prokaryoten. De -35-promotor bestaat uit een sequentie die TTGACA is en die actief betrokken is bij de regulatie van de snelheid van prokaryotische transcriptie.
Wat zijn de overeenkomsten tussen eukaryote en prokaryotische promotors?
- In beide typen worden de promotors gecontroleerd door verschillende DNA-regulerende sequenties, waaronder versterkers, geluiddempers, isolatoren en grenselementen.
- Promoters zijn de sequenties die transcriptie initiëren in prokaryoten en eukaryoten.
- Promotors zijn DNA-sequenties.
Wat is het verschil tussen eukaryote en prokaryotische promotors?
Eukaryote versus prokaryotische promotors |
|
| Eukaryote promotors zijn de regulerende sequenties die de transcriptie van eukaryote organismen initiëren. | Prokaryote promotors zijn de regulerende sequenties die de transcriptie van prokaryotische genen initiëren. |
| Elementen | |
| Prokaryote promotor bestaat uit stroomopwaartse elementen, -10 elementen en -35 elementen. | Eukaryote promotor bestaat uit Pribnow-box (TATA-box), CAAT-box, GC-box en initiatorelementen. |
Samenvatting – Eukaryotische versus prokaryotische promotors
Een promotor is een DNA-gebied dat de initiatie van het proces genaamd transcriptie omvat. Deze promotors worden typisch stroomopwaarts van de startplaats van de transcriptie gevonden. De drie hoofddelen die een promotor vormen, zijn de kernpromotor, de proximale promotor en de distale promotor. In de context van eukaryoten zijn er vele aantallen bevorderende elementen in het promotorgebied die zeer geavanceerd en diverser zijn dan prokaryoten. Voorbeelden van enkele eukaryote promotorelementen zijn Pribnow-box (TATA-box), GC-box, CAAT-box enz. In prokaryoten zijn er twee belangrijke belangrijke promotorelementen, namelijk -10-element (dat 10 bp stroomopwaarts van de transcriptiestartplaats aanwezig is), -35 elementen (dat is 35 bp stroomopwaarts van de startplaats van de transcriptie aanwezig). -10 promotor initieert de transcriptie, en de -35 promotor reguleert transcriptie. Beide soorten promotors worden gecontroleerd door verschillende DNA-regulerende sequenties die versterkers, geluiddempers, isolatoren en grenselementen omvatten. Dit is het verschil tussen eukaryote en prokaryotische promotors.
Download de pdf van eukaryote versus prokaryotische promotors
U kunt de PDF-versie van dit artikel downloaden en gebruiken voor offline doeleinden volgens de citatienota. Download hier de PDF-versie: Verschil tussen eukaryote en prokaryotische promotor
