Het belangrijkste verschil tussen Cosmid en Phagemid is het type sequenties dat het bevat. Een Cosmid bevat een cos-plaats en een plasmide. Daarom is het een hybride vector, terwijl een faagmide een plasmide is dat een F1-replicatieoorsprong van de F1-faag bevat.
Cosmiden en faagmiden worden gebruikt voor kloneringsdoeleinden, vooral om grotere DNA-fragmenten te klonen. Deze worden veel gebruikt, vooral bij het klonen van genen die verantwoordelijk zijn voor de productie van verschillende eiwitten. Cosmiden en faagmiden worden ofwel alleen gerepliceerd als plasmiden of worden verpakt in virale deeltjes en vervolgens gerepliceerd.
Wat is een cosmide?
A Cosmid, waarnaar wordt verwezen als een hybride plasmide, omvat cos-plaatsen die zijn geëxtraheerd uit Lambda-faagdeeltjes en een plasmide. Deze cos-sites zijn lange fragmenten van DNA met 200 basenparen. Daarom hebben ze samenhangende of plakkerige uiteinden waardoor het plasmide in het virale DNA past. Daarom zijn de cos-sites van vitaal belang voor het verpakken van het DNA.
Er zijn drie cos-sites;
- cosN-site – betrokken bij het inkorten van de DNA-streng door terminase-activiteit
- cosB site – bezig met het vasthouden van de terminase.
- cosQ-site – betrokken bij het voorkomen van de afbraak van het DNA door DNases.
Figuur 01: Cosmid
Cosmiden kunnen ook enkelstrengs DNA of dubbelstrengs DNA repliceren met behulp van een geschikte replicatieoorsprong. Cosmiden bevatten gewoonlijk antibioticaresistentiegenen als markers voor de selectie van transformanten. Het gebruik van een cosmide als vector kan dus het klonen vergemakkelijken, en de restrictie-enzymdigestie van de vector kan deze fragmenten vervolgens extraheren.
Wat is een faagmide (fasmide)?
Phagemid, ook wel Phasmid genoemd, is ook een soort hybride vector. Phagemid bevat een speciale replicatieoorsprong die de f1-replicatieoorsprong wordt genoemd. De f1-oorsprong van replicatie wordt geëxtraheerd uit een f1-faag.
Phagemid kan zowel enkelstrengs als dubbelstrengs DNA repliceren. Replicatie kan ofwel plaatsvinden als een plasmide terwijl het onafhankelijke replicatie ondergaat of kan worden verpakt in faagdeeltjes en uiteindelijk bacteriële gastheer E coli infecteren. Bij het infecteren van de E coli-cellen vereist de f1-faag de aanwezigheid van een pilus. Daarom zijn de geslachtspili belangrijk tijdens het in vitro verpakken van Phagemids.
Wat zijn de overeenkomsten tussen cosmide en faagmide?
- Zowel Cosmid als Phagemid zijn kloneringsvectoren die worden gebruikt in recombinant-DNA-technologie.
- Cosmid en Phagemid kunnen enkelstrengs en dubbelstrengs DNA repliceren.
- Beide kunnen onafhankelijke replicatie ondergaan, vergelijkbaar met plasmiden.
- Cosmid en Phagemid kunnen in vitro verpakt worden en bacteriële cellen infecteren.
- Zowel Cosmid als Phagemid vereisen een geschikte oorsprong van replicatie voor klonen.
Wat is het verschil tussen cosmide en faagmide?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Cosmid is een hybride vector die een cos-site en een plasmide bevat. | Phagemid is een plasmide dat een F1-replicatieoorsprong van de F1-faag bevat. |
| Aanwezigheid van Cos-locaties | |
| Cos-sites zijn aanwezig in cosmide en zijn nodig voor in vitro verpakking. | Cos-sites zijn afwezig in phagemid. |
| Aanwezigheid van F1 Oorsprong van replicatie | |
| In cosmide kan de oorsprong van replicatie al dan niet aanwezig zijn. | F1 replicatieoorsprong is aanwezig in faagmide. |
| Aanwezigheid van antibioticaresistente genen | |
| Antibiotic-resistente genen zijn aanwezig in cosmiden om de transformanten van niet-transformanten te identificeren. | Antibiotica-resistente genen ontbreken in fagemiden. |
| Vereiste van in vitro verpakking | |
| Vereist een cos-site. | Vereist een sekspilus. |
Samenvatting – Cosmid vs Phagemid
Cosmid en Phagemid zijn kloneringsvectoren die worden gebruikt in recombinant-DNA-technologie. Cosmiden zijn hybride vectoren die speciale plakkerige uiteinden bevatten die bekend staan als cos-sites. in vitro verpakkingen vereisen deze co-locaties. Terwijl fagemiden plasmiden zijn die een fl-replicatieoorsprong bevatten die is geëxtraheerd uit fl-faag. Zowel cosmide als faagmide kunnen onafhankelijke replicatie of in vitro verpakking naar bacteriële cellen ondergaan. Dit zijn de belangrijke verschillen tussen cosmide en phagemid.
