Het belangrijkste verschil tussen gen-knock-out en knock-down is dat de gen-knock-out een techniek is waarbij het gen van belang volledig wordt verwijderd (in-operatieve toestand) om de functies van het gen te bestuderen, terwijl gen-knockdown een andere techniek is waarbij het gen van interesse wordt tot zwijgen gebracht om de rol van het specifieke gen in een biologisch systeem te onderzoeken.
Er zijn verschillende genetische technieken in gebruik om de werking van genen binnen de levende biologische systemen te onderzoeken. Gene knock-out en knockdown zijn twee van dergelijke technieken. Deze technieken helpen wetenschappers om functionele aspecten van verschillende genen in levende organismen te identificeren.
Wat is Gene Knockout?
Gene knock-out is een genetische techniek die ervoor zorgt dat een of meer genen in levende organismen onbruikbaar worden. Dit is ook een proces van het uitschakelen of verwijderen van een gen van een organisme. De primaire toepassing van deze techniek is het bestuderen van de genfunctie. Het proces evalueert het effect van het verloren of verwijderde gen. Het knock-outproces omvat ook bepaalde enzymen en splitsingstechnieken.
Figuur 01: Gene Knockout
Er zijn weinig variaties in de gen-knockout-techniek op basis van het aantal betrokken genen. Het zijn dubbele knock-out (knock-out van twee genen), drievoudige knock-out (knock-out van drie genen) en viervoudige knock-out (knock-out van vier genen). Gene knock-out wordt verder ingedeeld in twee groepen; heterozygote knockouts en homozygote knockouts.
Wat is Gene Knockdown?
Gene knockdown is een experimentele procedure waarbij deze procedure de expressie van een bepaald gen of bepaalde genen van een organisme onderdrukt of vermindert. Gen-uitschakeling is de algemene definitie voor gen-knockdown. Tijdens deze procedure omvat de activering of de afbraak van het geproduceerde mRNA RNA-interferentie (RNAi), klein interfererend RNA (siRNA) en kort haarspeld-RNA (shRNA).
Figuur 02: Gen-uitschakeling
Het primaire gebruik van gen knockdown is om de rol van het specifieke gen in het biologische systeem te onderzoeken. Daarom bewerkstelligt deze techniek de studie van oncogenen (Bcl-2 en P53) en genen die neurologische ziekten, virale infecties en erfelijke ziekten veroorzaken.
Wat zijn de overeenkomsten tussen Gene Knockout en Knockdown?
- Zowel gen-knock-out als gen-knock-down zijn genetische technieken.
- Deze twee technieken kunnen genexpressie voorkomen.
- Het primaire gebruik van beide technieken is het onderzoeken van de functie van het gen van belang.
- Beide zijn in staat om verschillende ziektetoestanden (genetisch) te identificeren.
- Ze kunnen allebei worden gebruikt voor een of meer genen van belang.
Wat is het verschil tussen Gene Knockout en Knockdown?
Gene Knockout vs Knockdown |
|
| Gene knock-out is de werking van genen (verwijdering van genen uit DNA) van een organisme door middel van verschillende genetische technieken. | Gene knockdown is een experimentele procedure om de expressie van een bepaald gen of bepaalde genen van een organisme te onderdrukken (verminderen of dempen). |
| Functie | |
| Vergemakkelijkt de studie van functies van genen door de resultaten van het verloren gen te analyseren. | Vergemakkelijkt de studie van oncogenen, genen die neurologische ziekten, virale infecties en erfelijke ziekten veroorzaken. |
| Betrokkenheid van RNA-agentia | |
| Betrokkenheid van RNA-agentia is onbeduidend bij deze techniek. | Het proces omvat de middelen zoals siRNA, shRNA en RNAi om het mRNA te inactiveren. |
| Gebruik van chemische middelen | |
| Enzymatische middelen worden gebruikt. | Er worden geen chemische middelen gebruikt. |
| Effect op gen | |
| Verwijdert het gen volledig uit het DNA. | Onderdruk of demp het gen. |
| Classificatie | |
| Dubbele knock-out, drievoudige knock-out en viervoudige knock-out en heterozygote en homozygote knock-out zijn verschillende soorten gen-knock-out. | Geen dergelijke classificatiesystemen beschikbaar voor genuitschakeling. |
Samenvatting – Gene Knockout vs Gene Knockdown
De twee technieken die we hier hebben besproken; de gen-knock-out en knock-down, zijn methoden om de functies van verschillende genen te onderzoeken. Gen-knock-out maakt het gen volledig onwerkzaam, terwijl gen-knock-out het gen van belang tot zwijgen brengt. Beide procedures voorkomen echter de genexpressie. Verschillende agenten zijn in staat om deze twee processen uit te voeren. Gen-knock-out is een soort deletie, terwijl gen-knock-out een soort inactivatie is. Dit is het verschil tussen gen-knock-out en knock-down.
