Het belangrijkste verschil tussen actieve plaats en bindingsplaats is dat een actieve plaats de katalyse van een chemische reactie helpt, terwijl een bindingsplaats helpt bij de binding van een ligand aan een groot molecuul.
Een bindingsplaats is een gebied op een eiwit, DNA of RNA, waaraan een ligand kan binden. Enzymen zijn eiwitten. Een actieve plaats is een gebied op een enzym waaraan de substraten kunnen binden om een chemische reactie te ondergaan. Dit specifieke gebied heeft ook een bindingsplaats samen met een katalytische plaats. Daarom helpen bindingsplaatsen alleen bij de binding van een ligand aan een groot molecuul, terwijl actieve plaatsen zowel de binding van een ligand aan een groot molecuul helpen, terwijl het een gekatalyseerde chemische reactie laat ondergaan.
Wat is een actieve site?
De actieve plaats is een gebied op een enzym waaraan de substraten van een chemische reactie binden om een gekatalyseerde chemische reactie te ondergaan. deze regio bestaat uit twee subregio's als bindingsplaats en katalytische plaats. De bindingsplaats bevat enkele resten die kunnen helpen bij de binding van het substraat (reactanten) aan het enzym. De katalytische plaats helpt bij het katalyseren van de chemische reactie. Bovendien is dit gebied erg klein in vergelijking met het hele volume van het enzym; ongeveer 10-20% van het totale volume van het enzym.
Figuur 01: De bindingssite en katalytische site van een actieve site
Meestal bevat de actieve site 3-4 aminozuren. de rest van de aminozuren in het enzym zijn betrokken bij het in stand houden van de tertiaire structuur van het enzym. Wat nog belangrijker is, is dat een actieve site een specifiek ontwerp heeft dat past bij een specifiek substraat. Daarom reageren deze enzymen alleen met bepaalde substraten. Maar soms hebben enzymen cofactoren nodig voor hun functie. De belangrijkste functie van de actieve site is het verminderen van de activeringsenergie van een chemische reactie, waardoor de reactiesnelheid wordt verhoogd.
Wat is Binding Site?
Bindingsplaats is een gebied op een eiwit, DNA of RNA waaraan liganden kunnen binden. Daar kan het ligand een chemische binding aangaan met deze site. Deze regio's vertonen specificiteit; een bepaald ligand zal binden aan een bepaalde bindingsplaats. Daarom is deze site een maat voor de soorten liganden die aan een molecuul kunnen binden.
Bovendien gebruiken we deze regio's vaak voor de functionele karakterisering van biomoleculen. We kunnen bijvoorbeeld de functionaliteit van een actieve site karakteriseren via zijn bindingssite. Bovendien is in het geval van DNA het specifieke type bindingsplaats de transcriptiefactorbindingsplaats die aanwezig is op het DNA.
Wat is het verschil tussen actieve site en bindende site?
Actieve plaats is een gebied op een enzym waaraan de substraten van een chemische reactie binden om een gekatalyseerde chemische reactie te ondergaan, terwijl de bindingsplaats een gebied op een eiwit, DNA of RNA is, waaraan liganden kunnen binden. Dit is het belangrijkste verschil tussen de actieve site en de bindingssite. Bovendien zijn de actieve plaatsen aanwezig op enzymen en helpen ze de reactiesnelheid van een bepaalde chemische reactie te verhogen door de activeringsenergiebarrière van die reactie te verlagen. Bindingsplaatsen daarentegen zijn verantwoordelijk voor de binding van een specifiek ligand aan een bepaald molecuul.
De onderstaande infographic presenteert het verschil tussen actieve site en bindingssite in tabelvorm.
Samenvatting – Actieve site versus bindende site
Actieve plaatsen zijn gebieden op enzymen die de reactiesnelheid van een chemische reactie kunnen verhogen door de activeringsenergiebarrière van die reactie te verminderen. Een bindingsplaats is elk gebied waaraan een ligand kan binden. Actieve site bevat ook een bindingsplaats. Het verschil tussen actieve site en bindingssites ligt in het bestaan en de functionaliteit. Daarom is het belangrijkste verschil tussen actieve plaats en bindingsplaats dat een actieve plaats de katalyse van een chemische reactie helpt, terwijl een bindingsplaats helpt bij de binding van een ligand aan een groot molecuul.
