Belangrijk verschil - Gensequencing versus DNA-vingerafdrukken
Sequencing van DNA is een belangrijke techniek in de moleculaire genetica waarbij de nucleotidesequentie van een bepaalde DNA-sequentie of het hele genoom van een organisme wordt bepaald. Hierdoor kan de onderzoeker of diagnosticus de mutaties van DNA-sequenties bepalen en het ene organisme van het andere onderscheiden op basis van hun genetische samenstelling. Gene sequencing is de sequencing procedure van een gen of een DNA fragment via Sanger sequencing of Next generation sequencing. DNA-fingerprinting omvat een techniek die bekend staat als Restriction Fragment length polymorphism (RFLP), waarbij DNA-monsters van twee of meer proefpersonen worden gefragmenteerd en geanalyseerd om de identiteit van een persoon te bepalen. Dit is het belangrijkste verschil tussen gensequencing en DNA-fingerprinting.
Wat is gensequentiebepaling?
Gensequencing wordt gedaan om de nucleotidesequentie van een bepaald gen te bepalen. Als het hele genoom wordt gesequenced, wordt dit Whole Genome-sequencing genoemd. Aanvankelijk werd gensequencing gedaan met behulp van chemische methoden die schadelijke chemicaliën zoals pyridine gebruikten; deze techniek werd al snel stopgezet vanwege de toxische aard van het experiment. Op dit moment wordt sequencing van een gen meestal gedaan met behulp van een methode die bekend staat als Sanger-sequencing, waarbij gebruik wordt gemaakt van een ketenbeëindigingsstap door deoxyribonucleïnezuren. De reactie wordt uitgevoerd in vier afzonderlijke reageerbuisjes waarbij in elke reageerbuis de primer wordt gelabeld met een fluorescentiemarker die uiteindelijk de volgorde van het specifieke fragment zal bepalen. Geautomatiseerde Sanger-sequencing gebruikt een detector om de fluorescentiesignalen te detecteren en de resultaten te leveren.
Figuur 01: DNA-sequencing
Next Generation-sequencing is de meest recente ontwikkeling van sequencing-methoden en is een techniek met hoge doorvoer die gelijk staat aan het uitvoeren van 1000 Sanger-sequencing-reacties tegelijk. De belangrijkste kenmerken van Next Generation Sequencing zijn;
- Zeer parallel – veel sequentiereacties vinden tegelijkertijd plaats.
- Microschaal - reacties zijn klein en veel kunnen tegelijk op een chip worden gedaan.
- Snel – aangezien reacties parallel worden uitgevoerd, zijn de resultaten veel sneller klaar.
- Kortere lengte – reads variëren doorgaans van 505050 -700700700 nucleotiden lang.
Gensequencing wordt voornamelijk gebruikt om de sequentie van een nieuw gen te bepalen of om mutaties van een gen dat aanwezig is in zieke toestanden te analyseren en om de genetische basis van ziekten te bevestigen. Het wordt ook toegepast op het gebied van agrarische biotechnologie om nieuwe variëteiten van plantensoorten te bepalen en om plantengenen te identificeren die verantwoordelijk zijn voor gunstige agronomische eigenschappen zoals resistentie tegen plagen, ziekteresistentie en droogteresistentie.
Wat is DNA-vingerafdrukken?
DNA-vingerafdrukken is een techniek die voornamelijk wordt gebruikt in forensisch onderzoek om de identiteit te bevestigen van een persoon die betrokken is bij een forensisch onderzoek. Vroeger werd DNA-fingerprinting gedaan met behulp van een hybridisatietechniek met behulp van fluorescerende of radiogelabelde markers. Op dit moment wordt DNA-fingerprinting gedaan met behulp van de techniek RFLP. Deze techniek maakt gebruik van restrictie-enzymen, enzymen die DNA op specifieke sequenties kunnen hakken. Wanneer twee monsters voor analyse worden gebracht, worden beide monsters gedigereerd met dezelfde restrictie-enzymen om fragmenten op te leveren. Als de twee monsters vergelijkbaar zijn, moet het beeld van de elektroforesegel voor beide monsters identiek zijn. Als het niet vergelijkbaar is, zijn de gelafbeeldingen niet identiek. Zo kan de identiteit van een persoon worden bevestigd door middel van deze techniek.
DNA-vingerafdrukken worden meestal gebruikt om de ware verdachte van een plaats delict te vinden door de beschikbare biologische monsters op de plaats delict te analyseren. Uit deze beschikbare monsters (haar/sperma/spuug/bloed) wordt DNA geëxtraheerd en met de DNA-monsters van de verdachten geanalyseerd om de ware dader te achterhalen.
Wat zijn de overeenkomsten tussen gensequentiebepaling en DNA-vingerafdrukken?
- In beide gevallen is het geanalyseerde monster een DNA-monster.
- Elektroforese wordt gebruikt om de resultaten in beide technieken te bepalen.
Wat is het verschil tussen gensequentiebepaling en DNA-vingerafdrukken?
Gensequencing versus DNA-vingerafdrukken |
|
| Gensequencing is het proces dat de nucleotidesequentie van een bepaald gen of het hele genoom bepa alt. | DNA-fingerprinting omvat een techniek waarbij DNA-monsters van twee of meer proefpersonen worden gefragmenteerd en geanalyseerd om de identiteit van een persoon te bepalen. |
| Basis van de technologie | |
| Sequencing-methoden zoals Sanger-sequencing of Next Generation-sequencing worden gebruikt bij gensequencing. | Restrictiefragmentlengte-polymorfisme wordt gebruikt om twee monsters van proefpersonen te analyseren bij DNA-fingerprinting. |
| Toepassingen | |
| Gensequencing wordt voornamelijk gebruikt in genetische studies om nieuwe genen te analyseren, mutaties te identificeren en om gevolgtrekkingen te ontwikkelen op basis van genetische diagnostiek. | DNA-vingerafdrukken worden gebruikt in forensisch onderzoek om conclusies te trekken over de identiteit van een verdachte. |
Samenvatting – Gensequentiebepaling versus DNA-vingerafdrukken
Gensequencing en DNA-fingerprinting zijn twee populaire tests geworden die worden uitgevoerd om een bepaald gen te karakteriseren of om een bepaalde persoon te identificeren met behulp van de genetische vingerafdruk van de persoon. Deze technieken zijn nauwkeurig en snel en worden uitgevoerd door bekwaam personeel om bevestigde resultaten te verkrijgen. Het verschil tussen gensequencing en DNA-fingerprinting is dat gensequencing zich richt op het vinden van de exacte nucleotidevolgorde van het gen, terwijl DNA-fingerprinting zich richt op bevestiging van de identiteit van individuen in forensisch onderzoek.
Download de PDF-versie van gensequentiebepaling versus DNA-vingerafdrukken
U kunt de PDF-versie van dit artikel downloaden en gebruiken voor offline doeleinden volgens de citatienota. Download hier de PDF-versie. Verschil tussen gensequentiebepaling en DNA-vingerafdrukken
