Het belangrijkste verschil tussen protomeren en capsomeren is dat protomeren structurele eenheden van oligomere eiwitten zijn, terwijl capsomeren individuele eiwitten zijn die zijn samengesteld uit protomeren, die structurele subeenheden van de virale capside zijn.
Een virus is een intracellulaire obligate parasiet, een infectieus deeltje. De capside is een van de twee belangrijkste componenten van een virusdeeltje. Het is een eiwitmantel die het virale genoom omringt en beschermt. Een capside bestaat uit protomeren, de structurele eenheden van oligomere eiwitten. Capsomeer is een structurele subeenheid van de virale capside en het is een aggregatie van verschillende protomeren als een eenheid. Dus protomeren assembleren zichzelf om een capsomeer te vormen en capsomeren assembleren zichzelf om een capside te vormen.
Wat zijn protomers?
Protomeren zijn de structurele eenheden van oligomere eiwitten. Protomer bevat ten minste twee verschillende polypeptideketens. Vaker bevatten ze meerdere polypeptiden. In virale capsiden assembleren protomeren zichzelf om capsomeren te vormen, de morfologische eenheden van capsiden. Protomers verbinden zich met elkaar via specifieke bindingen en assembleren zichzelf.
Figuur 01: Protomers
In het tabaksmozaïekvirus aggregeren protomeren om een tweelaagse schijf te vormen die het RNA-genoom omhult. Zo vormen deze protomeren van het tabaksmozaïekvirus uiteindelijk een lange stijve holle buis, waardoor het een spiraalvormig uiterlijk krijgt. In icosahedrale symmetrie aggregeren protomeren in eenheden van vijf of zes capsomeren en condenseren ze vervolgens in 20 vlakken van gelijkzijdige driehoeken en 20 toppen.
Wat zijn capsomeren?
Capsomeren zijn de structurele eiwitsubeenheden van het virale capside. Ze zijn ook de morfologische subeenheden van virussen. Structureel is de capside een verzameling capsomeren. Elke capsomeer heeft verschillende protomeren die zelf met elkaar zijn geassembleerd. Bovendien zijn capsomeren anders gerangschikt in de capside om de virale capside een vorm te geven. In dit opzicht zijn spiraalvormig, icosahedraal en complex de drie soorten capsomer-arrangementen in virussen. De rangschikking van capsomeren is echter kenmerkend voor een bepaald virus. Capsomeren verbinden zich met elkaar via intercapsomere triplexen die bestaan uit twee kopieën van het ene eiwit en een kopie van het andere.
Figuur 02: Capsomeren
Bovendien heeft elk virus een eindig aantal capsomeren. Hepatitis B-virus heeft een icosahedrale capside met 180 capsomeren. Recombinant adenovirus heeft een capside dat 252 capsomeren bevat. Herpesvirussen hebben 162 capsomeren in hun capsiden. Bovendien heeft enterovirus 60 capsomeren in zijn capside. Evenzo hebben verschillende virussen een verschillend aantal capsomeren in hun eiwitschil.
Capsomeren vervullen verschillende functies in virussen. Capsomeren beschermen het virale genoom tegen fysieke, chemische en enzymatische schade. Bovendien zijn capsomeren belangrijk bij het introduceren van een viraal genoom in de gastheer door gemakkelijk te adsorberen aan celoppervlakken van de gastheer.
Wat zijn de overeenkomsten tussen protomeren en capsomeren?
- Protomeren en capsomeren zijn eiwitstructuren.
- Protomeren zijn subeenheden van capsomeren, terwijl capsomeren subeenheden zijn van de virale capside.
- Zowel protomeren als capsomeren kunnen zichzelf assembleren.
Wat is het verschil tussen protomeren en capsomeren?
Protomeren zijn de structurele eenheden die oligomere eiwitten maken, terwijl capsomeren de morfologische eenheden zijn van virale capsiden. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen protomeren en capsomeren. Bovendien aggregeren protomeren om capsomeren te vormen, terwijl capsomeren aggregeren om capside te vormen.
De onderstaande infographic vat het verschil tussen protomeren en capsomeren samen.
Samenvatting – Protomers vs Capsomeren
Protomeren zijn subeenheden van capsomeren, terwijl capsomeren eiwitsubeenheden van het virale capside zijn. Capsomeer is dus een aggregatie van protomeren, terwijl capside een aggregatie van capsomeren is. Opstelling van protomeren of opstelling van capsomeren geeft vorm of symmetrie aan een bepaald virus. Gebaseerd op de rangschikking van capsomeren, zijn spiraalvormig en icosahedraal twee vormen of symmetrieën die worden gezien in virussen. Dit vat dus het verschil tussen protomeren en capsomeren samen.
