Het belangrijkste verschil tussen LAMP- en PCR-test is dat LAMP wordt uitgevoerd bij constante temperatuur (60-650C) om kopieën van DNA te produceren door middel van amplificatie, terwijl PCR wordt uitgevoerd met behulp van een reeks temperatuurveranderingen om kopieën van DNA te produceren door middel van amplificatie.
LAMP en PCR zijn beide in vitro amplificatietechnieken die worden gebruikt om duizenden kopieën van DNA te produceren. De hoeveelheid DNA geproduceerd in LAMP is veel hoger dan de hoeveelheid geproduceerd in PCR-technieken zoals RT-PCR. LAMP is een nieuwere techniek in vergelijking met de PCR-techniek. Maar het is technisch eenvoudig en gemakkelijk voor een getrainde wetenschapper om te presteren in laboratoriumomstandigheden. Dit maakt het een potentieel bruikbare techniek voor de detectie van COVID-19. RT-PCR is echter de huidige standaardtest voor COVID-19. Deze technieken, hoewel bekend bij onderzoekers en clinici met een achtergrond in DNA-amplificatie, zijn mogelijk nog relatief onbekend bij een bredere gemeenschap.
Wat is LAMP-test?
Loop-gemedieerde isotherme amplificatie (LAMP) voor COVID-19-assays begint met het verzamelen van monsters uit de neus of keel met behulp van een wattenstaafje. De monsters kunnen ook worden verzameld met behulp van andere methoden, zoals slijm van harde hoest. Net als de PCR-techniek zoals RT-PCR, wordt het virale RNA in het monster eerst omgezet in DNA, waardoor het gekopieerd kan worden. De LAMP-reactie wordt uitgevoerd bij constante temperatuur (60-650C).
De amplificatie van viraal DNA met behulp van LAMP-technologie en reagentia kan worden gedetecteerd wanneer het reactiemengsel troebel wordt door de productie van "magnesiumpyrofosfaat". Deze bewolking maakt een gemakkelijke diagnose van COVID-19 door wetenschappers en clinici mogelijk. De nauwkeurigheid van testresultaten kan worden verbeterd door speciale fluorescerende kleurstoffen of kleurveranderende kleurstoffen in het reactiemengsel te gebruiken. Deze kleurstoffen interageren met viraal DNA en de intensiteit van de licht- of kleurverandering kan worden gemeten om het aantal virale RNA-moleculen te geven dat ongeveer aanvankelijk in het monster aanwezig was.
Wat is PCR-test?
PCR is een veel voorkomende wetenschappelijke techniek die al 20-30 jaar op grote schaal wordt gebruikt in onderzoek en geneeskunde om DNA te detecteren. PCR-tests worden direct gebruikt om een antigeen te detecteren door viraal RNA te detecteren. Over het algemeen is viraal RNA in het lichaam aanwezig voordat antilichamen worden gedetecteerd of de symptomen van de ziekte worden verkregen. Daarom kan een PCR-test al vroeg uitwijzen of iemand het virus heeft of niet. Momenteel is PCR de standaardtest voor het detecteren van COVID-19. Er zijn verschillende soorten PCR-technieken, zoals real-time PCR, geneste PCR, multiplex PCR, hot start PCR en langeafstands-PCR, enz. PCR gebruikt een reeks temperatuurveranderingen om kopieën van DNA te produceren door middel van amplificatie.
RT-PCR is een speciale versie van de PCR-techniek. Het wordt gebruikt wanneer RNA wordt gedetecteerd. Het wordt nu gebruikt om COVID-19 te testen. RT-PCR is een vrij gevoelige en betrouwbare techniek. In RT-PCR worden, zodra een monster is verzameld, chemicaliën gebruikt om ongewenste eiwitten, vetten en andere moleculen te verwijderen, waardoor het RNA achterblijft. De enzymen van de testkit zetten RNA eerst om in DNA, dat vervolgens viraal DNA versterkt om het virus te detecteren. Fluorescerende kleurstoffen worden typisch gebruikt om aan het geamplificeerde DNA te binden en licht te produceren. Dit kan door de machine worden gelezen om het testresultaat te produceren.
Wat zijn de overeenkomsten tussen LAMP en PCR-test?
- Het zijn versterkingstechnieken.
- Beide produceren gekopieerd DNA.
- Het zijn zeer gevoelige en betrouwbare technieken dan immuuntechnieken zoals antilichaamdetectie.
- Ze worden allebei gebruikt voor COVID-19-tests.
Wat is het verschil tussen LAMP en PCR-test?
Het belangrijkste verschil tussen LAMP- en PCR-tests is dat bij LAMP amplificatie wordt bereikt met een constante temperatuur (60-650C), terwijl bij PCR cycli van temperaturen vereist. Er zijn momenteel verschillende soorten LAMP-technieken beschikbaar. Maar de belangrijkste voor COVID-19-detectie zijn reverse transcription loop-gemedieerde isotherme techniek (RT-LAMP) en transcript-gemedieerde amplificatie (TMA). Bovendien zijn er momenteel ook verschillende soorten PCR-technieken beschikbaar in de klinische praktijk voor ziektediagnose, zoals real-time PCR, RT-PCR, geneste PCR, multiplex-PCR, hot-start PCR, lange-afstands-PCR, enz.
De onderstaande infographic geeft een overzicht van de verschillen tussen de LAMP- en PCR-test in tabelvorm.
Samenvatting – LAMP vs PCR-test
Loop-gemedieerde isotherme amplificatie is een proces dat vergelijkbaar is met PCR-tests zoals RT-PCR, maar het produceert meer virale DNA-kopieën bij een constante temperatuur. Polymerasekettingreactietest is momenteel de meest voorkomende en standaardvorm van testen ter wereld voor ziektediagnose, zoals de diagnose van COVID-19. Het wordt als redelijk betrouwbaar gezien. PCR gebruikt een reeks temperatuurveranderingen om kopieën van DNA te produceren door middel van amplificatie. Dit vat dus het verschil samen tussen de LAMP- en PCR-test.
