Het belangrijkste verschil tussen guanidinethiocyanaat en guanidinehydrochloride is dat guanidinethiocyanaat een sterkere eiwitdenatureringsmiddel is dat vaker wordt gebruikt bij RNA-isolatie, terwijl guanidinehydrochloride een zwakker eiwitdenatureringsmiddel is dat minder vaak wordt gebruikt bij RNA-isolatie.
Denaturatie is het proces waarbij eiwitten hun quaternaire structuur, tertiaire structuur en secundaire structuur verliezen die normaal aanwezig zijn in hun oorspronkelijke staat. Het kan worden gedaan door de toepassing van een aantal externe stress of verbindingen zoals een sterk zuur of base, een geconcentreerd anorganisch zout, een organisch oplosmiddel (alcohol, chloroform), agitatie, straling of hitte. Guanidinethiocyanaat en guanidinehydrochloride zijn twee verschillende soorten eiwitdenaturatiemiddelen.
Wat is Guanidine Thiocyanaat?
Guanidinethiocyanaat (GTC) is een sterker eiwitdenatureringsmiddel dat vaker wordt gebruikt bij RNA-isolatie. Het is ook bekend als guanidiniumisothiocyanaat (GITC). Omdat het een chaotroop middel is, is het een chemische verbinding die routinematig wordt gebruikt als algemeen eiwitdenatureringsmiddel. Een chaotroop middel is een molecuul in een wateroplossing die het waterstofbindingsnetwerk tussen watermoleculen kan verstoren. Dit heeft een effect op de stabiliteit van de natieve toestand van andere moleculen in de oplossing, zoals macromoleculen zoals eiwitten en nucleïnezuren door het hydrofobe effect te verzwakken. Chaotrope middelen zoals guanidinethiocyanaat verminderen de hoeveelheid orde in de structuur van eiwitten gevormd door watermoleculen, zowel in bulk als hydratatieschillen rond hydrofobe aminozuren. Dit kan eiwitdenaturatie veroorzaken.
Guanidinethiocyanaat kan worden gebruikt om virussen zoals griep te deactiveren die ziekten zoals de Spaanse griep in 1918 veroorzaakten. Daarom kan het worden gebruikt in medische of ziekenhuisopstellingen. Verder wordt Guanidinethiocyanaat ook gebruikt om cellen en virusdeeltjes te lyseren in RNA- en DNA-extracties. Hier is de functie van guanidinethiocyanaat het ondersteunen van de lyserende werking en het voorkomen van de activiteit van RNase-enzymen en DNase-enzymen door denaturering. Deze enzymen zouden anders het extract (RNA of DNA) beschadigen.
Wat is Guanidine Hydrochloride?
Guanidinehydrochloride (GdnHCl) is een zwakker eiwitdenatureringsmiddel dat minder vaak wordt gebruikt bij RNA-isolatie. Het is ook bekend als guanidiniumchloride (GdmCl). Het is het hydrochloridezout van guanidine. Guanidinehydrochloride is chaotroop en een van de denatureermiddelen die worden gebruikt in de fysisch-chemische studies van eiwitvouwing.
Figuur 01: Guanidine Hydrochloride
Guanidinehydrochloride heeft ook het vermogen om de enzymactiviteit te verminderen en de oplosbaarheid van hydrofobe moleculen te verhogen. Normaal gesproken verliezen eiwitten bij hogere concentraties guanidinehydrochloride hun geordende structuur. Eiwitten hebben de neiging om willekeurig opgerold te worden bij deze concentratie guanidinehydrochloride. In medische of ziekenhuisopstellingen is guanidinehydrochloride geïndiceerd voor de vermindering van de symptomen van spierzwakte en gemakkelijke vermoeidheid geassocieerd met de ziekte Eaton-Lambert-syndroom. Bovendien kunnen bijwerkingen van het gebruik van guanidinehydrochloride perist altiek, diarree en fatale beenmergsuppressie omvatten.
Wat zijn de overeenkomsten tussen guanidinethiocyanaat en guanidinehydrochloride?
- Guanidinethiocyanaat en guanidinehydrochloride zijn twee verschillende soorten eiwitdenaturatiemiddelen.
- Beide denaturanten hebben guanidine in hun structuren.
- Het zijn chaotrope middelen.
- Beide denatureermiddelen kunnen worden gebruikt voor RNA-isolatie.
- Ze worden beide gebruikt in medische of ziekenhuisopstellingen.
Wat is het verschil tussen Guanidine Thiocyanaat en Guanidine Hydrochloride?
Guanidinethiocyanaat is een sterker eiwitdenatureringsmiddel dat vaker wordt gebruikt bij RNA-isolatie, terwijl guanidinehydrochloride een zwakker eiwitdenatureringsmiddel is dat minder vaak wordt gebruikt bij RNA-isolatie. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen guanidinethiocyanaat en guanidinehydrochloride. Verder is de chemische formule van guanidinethiocyanaat C2H6N4S, terwijl de chemische formule van guanidinehydrochloride is CH5N3HCl.
De onderstaande infographic presenteert de verschillen tussen guanidinethiocyanaat en guanidinehydrochloride in tabelvorm voor een zij-aan-zij vergelijking.
Samenvatting – Guanidine Thiocyanaat vs Guanidine Hydrochloride
Guanidinethiocyanaat en guanidinehydrochloride zijn twee verschillende soorten eiwitdenaturatiemiddelen. Beide denaturanten zijn chaotropen. Guanidinethiocyanaat is een sterker eiwitdenatureringsmiddel dat vaker wordt gebruikt bij RNA-isolatie, terwijl guanidinehydrochloride een zwakker eiwitdenatureringsmiddel is dat minder vaak wordt gebruikt bij RNA-isolatie. Dit vat dus het verschil samen tussen guanidinethiocyanaat en guanidinehydrochloride.
