Het belangrijkste verschil tussen xyleencyaan en broomfenolblauw is dat in 1% agarosegel xyleencyaan langzamer migreert, terwijl broomfenolblauw sneller migreert.
Xyleencyaan en broomfenolblauw zijn belangrijk als kleurmarkers die kunnen worden gebruikt bij het bewaken van het proces van agarosegelelektroforese en polyacrylamidegelelektroforese.
Wat is Xyleen Cyanol?
Xyleencyanol is een elektroforetische kleurmarkering of een volgkleurstof. Het is nuttig bij het bewaken van het proces van agarosegelelektroforese en polyacrylamidegelelektroforese. Wanneer deze stof met het monster wordt gemengd, wordt de concentratie van deze stof typisch ongeveer 0.005% tot 0,03%. Enkele synoniemen die we kunnen gebruiken voor xyleencyanol zijn Acid Blue 147, xyleencyanole, xyleencyanol FF, xyleen cyanole FF, etc.
De chemische formule van deze verbinding is C25H27N2NaO 6S2 De molaire massa van xyleencyaan is 538,61 g/mol. Deze stof kan migreren met een snelheid van ongeveer 4 – 5 kilobasenpaar DNA-fragmenten in 1% agarosegels. Dit hangt echter af van de buffer die we gebruiken. Gewoonlijk kan xyleencyaan op 6% polyacrylamidegel migreren met een snelheid van ongeveer 140 basenparen DNA-fragmenten. Aan de andere kant kan het migreren in 20% denaturerende polyacrylamidegelelektroforese met een snelheid van 25 basen oligonucleotide.
Het aantal waterstofbruggen van xyleencyaan is 2 m en het aantal acceptoren van waterstofbruggen is 8. Het aantal draaibare bindingen van deze verbinding kan worden gegeven als 7. De complexiteit van xyleencyaan kan worden beschreven als 1120 graden. Het heeft een gedefinieerde binding stereocenter telling van 1.
Wat is broomfenolblauw?
Broomfenolblauw is een nuttige pH-indicator die nuttig is als elektroforetische kleurmarkering en als kleurstof. Het heeft de chemische naam 3', 3", 5', 5"-tetrabroomfenolsulfonftaleïne, BPB. De chemische formule van deze verbinding is C19H10Br4O5 S. De molmassa van deze verbinding is 669,96 g/mol. Het is geurloos en de dichtheid kan worden aangegeven als 2,2 g/mL. Het smeltpunt is 273 graden Celsius en het kookpunt is 279 graden Celsius. We kunnen het bereiden door langzaam overtollig broom toe te voegen aan een hete oplossing van fenolsulfonftaleïne in ijsazijn.
Broomfenolblauw is nuttig als zuur-base-indicator in het bereik van pH 3,0 tot 4,6. Het kan veranderen van geel bij pH 3,0 tot pH 4,6. Bovendien is het een omkeerbare reactie. Structureel is broomfenolblauw vergelijkbaar met fenolftaleïne.
Bovendien kunnen we het gebruiken als kleurmarkering om het proces van agarosegelelektroforese en polyacrylamidegelelektroforese te volgen. Deze stof kan een negatieve lading hebben bij een matige pH, waar het in dezelfde richting kan migreren als DNA of eiwit in een gel. De migratiesnelheid kan variëren afhankelijk van de geldichtheid en buffersamenstelling. In een typische 1% agarosegel in 1 keer TAE-buffer of TBE-buffer migreert deze stof echter met dezelfde snelheid als een DNA-fragment van ongeveer 300 basenparen.
Wat is het verschil tussen xyleencyanol en broomfenolblauw?
Xyleencyaan en broomfenolblauw zijn belangrijke kleurmarkeringen. Het belangrijkste verschil tussen xyleencyaan en broomfenolblauw is dat in 1% agarosegel xyleencyaan langzamer migreert, terwijl broomfenolblauw sneller migreert.
Hieronder is een samenvatting van het verschil tussen xyleencyaan en broomfenolblauw in tabelvorm voor een zij-aan-zij vergelijking.
Samenvatting – Xyleencyanol versus broomfenolblauw
Xyleencyaan en broomfenolblauw zijn belangrijk als kleurmarkers die worden gebruikt bij het bewaken van het proces van agarosegelelektroforese en polyacrylamidegelelektroforese. Het belangrijkste verschil tussen xyleencyaan en broomfenolblauw is dat in 1% agarosegel xyleencyaan langzamer migreert, terwijl broomfenolblauw sneller migreert.
