Het belangrijkste verschil tussen motief en domein is dat het motief niet onafhankelijk stabiel is, terwijl het domein onafhankelijk stabiel is.
Eiwitten zijn belangrijke biologische macromoleculen die in ons lichaam aanwezig zijn. Aan de andere kant bepa alt de genetische code van een gen de aminozuurvolgorde van een eiwit. Bovendien hebben eiwitten primaire, secundaire en tertiaire structuren. De primaire structuur is de aminozuursequentie van de polypeptideketen. Wanneer polypeptideketens met elkaar vouwen, vormt het de secundaire structuur van het eiwit. Alfa-helices, beta-sheets en super-secundaire structuren behoren tot de secundaire structuren. Bepaalde groepen super-secundaire elementen staan bekend als eiwitmotieven. De tertiaire structuur van een eiwit verwijst naar de driedimensionale structuur die de functie van het eiwit bepa alt. Domein is een gevouwen deel van een eiwitmolecuul, dat bolvormig is en een discrete functie heeft. Het is de fundamentele functionele en driedimensionale structuur van het eiwit.
Wat is motief?
Motief is een bepaalde groepering van de super secundaire elementen van eiwitten zoals alfa-helices en bètastructuren. Het zijn een soort patronen die aanwezig zijn in verschillende eiwitten. Motieven beschrijven de vouwpatronen van de secundaire structurele elementen en hun interacties. Deze vouwpatronen stabiliseren door soortgelijke verbindingen die aanwezig zijn in tertiaire structuren. Ze zijn echter niet zo complex als tertiaire structuren.
Figuur 01: Motief
Het zijn eenvoudige combinaties van secundaire structuren van eiwitten. Motief is op zichzelf niet stabiel. Bovendien verklaren motieven de structuur van een eiwit, maar voorspellen ze niet de functie van een eiwit. Voorbeelden van eiwitmotieven zijn een bèta-alfa-beta-motief, Grieks sleutelmotief, Beta-vat, Beta-meander-motief, enz.
Wat is domein?
Domein is een fundamentele, functionele en driedimensionale eenheid van een eiwit. Het vervult een bepaalde functie. Een enkel eiwit kan verschillende verschillende domeinen hebben. Elk domein is een zelfstandige eenheid. Het is een bolvormige structuur. Het is verantwoordelijk voor een specifieke functie of interactie. Domeinen kunnen worden gebruikt om de functie van een niet-gekarakteriseerd eiwit te veronderstellen. Bij het analyseren van een eiwit is het essentieel om er rekening mee te houden, aangezien domeinen de functionele eenheden van het eiwit zijn.
Figuur 02: Drie verschillende domeinen van pyruvaatkinase
Domeinen zijn zeer stabiele en compacte structuren. Ze zijn gemakkelijk te onderscheiden van andere regio's. Pyruvaatkinase heeft drie onderscheiden domeinen zoals weergegeven in figuur 02. De lengte van het domein kan variëren en de gemiddelde lengte is 100 aminozuren. Elk domein bevat een hydrofobe kern die is opgebouwd uit secundaire structurele eenheden. Verschillende domeinen vormen samen de tertiaire structuur van een eiwit.
Wat zijn de overeenkomsten tussen motief en domein?
- Motief en domein zijn eenheden die aanwezig zijn in eiwitmoleculen zelf.
- Ze zijn handig bij het classificeren van eiwitfamilies.
Wat is het verschil tussen motief en domein?
Motief is een bepaalde groepering van de super secundaire elementen van eiwitten zoals alfa-helices en bètastructuren, terwijl domein de functionele eenheid van een eiwit is. Bovendien is het motief een secundaire structuur, terwijl het domein verantwoordelijk is voor de tertiaire structuur van het eiwit. Bovendien is domein een onafhankelijke eenheid, in tegenstelling tot een motief. Ook geeft het domein de functie van een eiwit weer, terwijl het motief dat niet is. Dit zijn de belangrijkste verschillen tussen motief en domein. De onderstaande infographic presenteert het verschil tussen motief en domein in tabelvorm.
Samenvatting – Motief versus domein
Motief is een rangschikking van secundaire structuren van het eiwitmolecuul. Het is op zichzelf meestal niet stabiel, in tegenstelling tot een domein. Domein is een onafhankelijk stabiele structuur van een eiwit. Daarom kan het een gedeeltelijk of geheel eiwitmolecuul zijn. Het is een driedimensionale fundamentele functionele eenheid van het eiwit. Bovendien heeft het een functie en is het een zelfstandige eenheid. Motief kan deel uitmaken van het domein. Maar domein kan geen onderdeel zijn van een motief. Dit is het verschil tussen motief en domein.
