Belangrijk verschil – 16s rRNA vs 16s rDNA
Ribosomen zijn de biologische plaatsen van eiwitsynthese in alle levende organismen. Ribosomen bevatten twee componenten; kleine subeenheid en een grote subeenheid. Prokaryotische organismen en eukaryote organismen verschillen van de samenstelling van het ribosoom dat ze bevatten. Elke subeenheid is samengesteld uit ribosomaal RNA en verschillende eiwitten. Deze twee subeenheden passen bij elkaar en werken als één samen tijdens de eiwitsynthese. Prokaryotische ribosomen zijn de 70S en ze zijn samengesteld uit 30S kleine subeenheid en 50S grote subeenheid. Eukaryote ribosomen zijn 80S en ze zijn samengesteld uit 40S kleine subeenheid en 60S grote subeenheid. In prokaryoten staat ribosomaal RNA van de kleine subeenheid van ribosomen bekend als 16s-rRNA. Dit 16s-rRNA wordt getranscribeerd van het chromosomale DNA dat bekend staat als 16s-rDNA. 16s-rDNA is het gen dat door transcriptie 16s-rRNA produceert. Het belangrijkste verschil tussen het 16s rRNA en 16s rDNA is dat 16s rRNA het getranscribeerde enkelstrengs ribosomaal RNA is dat een onderdeel is van de kleine subeenheid van prokaryoten, terwijl 16s rDNA het dubbelstrengs chromosomale DNA is of het gen dat codeert voor 16s rRNA. Gen van het 16s rRNA is het 16s rDNA.
Wat is 16s rRNA?
rRNA is een onderdeel van ribosomen. 16s-rRNA is de specifieke component van de kleine 30S-subeenheid van het prokaryotische ribosoom dat bindt aan de Shine-Dalgarno-sequentie. Deze 16s-rRNA-sequentie vertoont een hoge variabiliteit tussen de bacteriesoorten. Daarom kan het worden gebruikt voor de bacteriële fylogenie en taxonomie.
Wat is 16s rDNA?
Prokaryoten hebben 70S-ribosomen. De kleine subeenheid van de prokaryotische ribosomen is de 30S. Het ribosomale RNA (rRNA) van de kleine 30S-subeenheid staat bekend als 16s-rRNA en het gen 16s-rDNA codeert het. Vandaar dat 16s-rDNA bekend staat als 16s-rRNA-gen. 16s-rDNA is chromosomaal DNA. Het is dubbelstrengs en het is een gen dat is samengesteld uit coderende en niet-coderende gebieden. Wanneer het 16s-rDNA-gen wordt getranscribeerd, produceert het de 16s-rRNA-sequentie. 16s rDNA is een universele DNA-sequentie in prokaryoten. De sequentie van het 16s-rDNA onder de prokaryoten varieert echter. Het vergemakkelijkt het gebruik van 16s rDNA-sequentie voor nauwkeurige identificatie van bacteriesoorten en ook voor de ontdekking van nieuwe bacteriesoorten.
16s rDNA speelt een belangrijke rol in bacteriële fylogenie en taxonomie. Daarom wordt het gebruikt als een betrouwbare moleculaire marker in fylogenetische studies van prokaryoten, omdat het sterk geconserveerd is tussen verschillende soorten. 16s rDNA-nucleotidesequentie heeft negen hypervariabele regio's (V1-V9) die een goede bron vormen voor differentiatie van bacteriën en archaea.
Figuur 01: DNA en RNA
De sequencing van het 16s rDNA-gen heeft de herclassificatie van de bacteriën in nieuwe soorten of geslachten vergemakkelijkt. Daarom wordt dit gen in moleculaire laboratoria gebruikt als een meest gebruikelijke huishoudmarker voor de identificatie van microben. Er zijn verschillende redenen waarom 16srDNA de beste marker is voor identificatie van microben, zoals de aanwezigheid van 16srDNA in alle bacteriën, de onveranderde functie van het 16s-rDNA-gen in de loop van de tijd en de grote omvang van 16s-rDNA waardoor het genoeg voor informatieve doeleinden.
Wat zijn de overeenkomsten tussen 16s rRNA en 16s rDNA?
- Beide zijn nucleïnezuren.
- Beide zijn opgebouwd uit nucleotiden.
- Beide zijn gerelateerd aan ribosomaal RNA.
Wat is het verschil tussen 16s rRNA en 16s rDNA?
16s rRNA vs 16s rDNA |
|
| 16s rRNA is de ribosomale RNA-component van de kleine subeenheid van 30s ribosoom van prokaryoten. | 16s rDNA is het chromosomale DNA dat codeert voor de 16s rRNA-sequentie van prokaryoten. |
| Aantal strengen | |
| 16s rRNA is enkelstrengs. | 16s rDNA is dubbelstrengs |
| Gen of Sequentie | |
| 16s rRNA is een getranscribeerd RNA van een gen. | 16s rDNA is een gen. |
| Coderingsvolgorde | |
| 16s rRNA heeft alleen de coderende sequentie. | 16s rDNA heeft zowel coderende als niet-coderende strengen. |
| Uracil-basis | |
| 16s rRNA bevat Uracil-basen in zijn nucleotidesequentie. | 16s rDNA bevat geen base Uracil in zijn nucleotidesequenties. |
| Thymin-basis | |
| 16s rRNA bevat geen thyminebasen in zijn nucleotidesequentie. | 16s rDNA bevat Thymine-basen in zijn nucleotidesequenties. |
| Synthese | |
| 16s rRNA wordt gemaakt na transcriptie van 16s rDNA-gen. | 16s rDNA zit in het genoom van de prokaryoten. |
Samenvatting – 16s rRNA vs 16s rDNA
16s rRNA is de ribosomale RNA-component van de kleine subeenheid van ribosomen van prokaryoten. Het gen 16s rDNA codeert voor deze RNA-sequentie. 16s-rRNA is enkelstrengs en 16s-rDNA is dubbelstrengs. Dit is het verschil tussen 16s rRNA en 16s rDNA.
Download de PDF 16s rRNA vs 16s rDNA
U kunt de PDF-versie van dit artikel downloaden en gebruiken voor offline doeleinden volgens de citatienota. Download hier de PDF-versie. Verschil tussen 16s rRNA en 16s rDNA
