Het belangrijkste verschil tussen TATA en CAAT-box is dat TATA-box een geconserveerd nucleotide-gebied is met een consensussequentie van TATAWAW, terwijl CAAT-box een geconserveerd nucleotide-gebied is met een consensussequentie van GGCCAATCT.
TATA-box en CAAT-box zijn twee regio's van nucleotiden die de transcriptie van eukaryote genen beïnvloeden. Het zijn niet-coderende DNA-sequenties die stroomopwaarts van de transcriptie-initiatieplaats worden gevonden. In feite worden ze gevonden in het regulerende gebied, dat bekend staat als de promotor. Zowel de TATA-box als de CAAT-box zijn verantwoordelijk voor de efficiëntie van transcriptie. Het zijn consensussequenties die tijdens het evolutieproces niet zijn veranderd.
Wat is TATA Box?
TATA-box of Goldberg-Hogness-box is een consensussequentie die wordt gevonden in het promotorgebied van eukaryote genen. TATA-box is een kernelement van de promotor. Het bevindt zich 25 basenparen stroomopwaarts van de transcriptie-initiatieplaats. Het blijft gedurende het hele evolutieproces behouden. De consensussequentie van TATA-box is TATAWAW, waarbij W ofwel A of T is. Het is een niet-coderende DNA-sequentie. TATA-box is echter belangrijk voor de transcriptie van het gen. Het is de bindingsplaats van TATA-bindend eiwit (TBP) en andere transcriptiefactoren. Zodra ze in de TATA-box binden, vindt de rekrutering van RNA-polymerase II en een goede regulatie van transcriptie plaats in eukaryote genen.
Figuur 01: TATA Box
Aangezien TATA-box betrokken is bij de regulatie van transcriptie, kunnen mutaties van TATA-box resulteren in fenotypische veranderingen die leiden tot ziekten zoals maagkanker, spinocerebellaire ataxie, de ziekte van Huntington, blindheid, β-thalassemie, immunosuppressie, het syndroom van Gilbert, en HIV-1, enz.
Wat is CAAT Box?
CAAT-box is een gebied van nucleotiden met de consensussequentie van GGCCAATCT. Net als bij TATA-box, bevindt CAAT-box zich ook in het promotorgebied van het gen. Daarom bevindt het zich ongeveer 75-80 basenparen stroomopwaarts van de transcriptieplaats.
Figuur 02: CAAT Box
Specifieke transcriptiefactoren binden aan de CAAT-box. Deze binding stabiliseert het pre-initiatiecomplex voor een gemakkelijkere binding van het enzym RNA-polymerase. Evenzo werkt de CAAT-box als een regulerende sequentie. Mutaties in het CAAT-boxgebied hebben een grote invloed op de promotorrespons en regulatie van transcriptie.
Wat zijn de overeenkomsten tussen TATA en CAAT Box?
- TATA en CAAT zijn twee regio's van nucleotiden die worden gevonden in de regulerende sequentie van eukaryote genen.
- Ze worden stroomopwaarts van de transcriptie-initiatieplaats gevonden.
- Beide zijn consensus-DNA-sequenties.
- Ze zijn essentieel voor de regulatie van transcriptie, dus het zijn regulerende sequenties.
Wat is het verschil tussen TATA en CAAT Box?
TATA-box is een geconserveerd nucleotidegebied dat ongeveer 25-30 basenparen stroomopwaarts van de transcriptie-initiatieplaats wordt gevonden. Aan de andere kant is CAAT-box een geconserveerd gebied van nucleotiden dat ongeveer 75-80 basenparen stroomopwaarts van de transcriptie-initiatieplaats wordt gevonden. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen TATA en CAAT-box. Bovendien heeft TATA-box een consensussequentie van TATAWAW, terwijl GGCCAATCT de consensussequentie van CAAT-box is.
Bovendien is een ander significant verschil tussen TATA en CAAT-box dat de TATA-box een bindingsplaats biedt voor TBP en transcriptiefactoren en deelneemt aan transcriptieregulatie, terwijl de CAAT-box de bindingsplaats voor de RNA-transcriptiefactor signaleert.
Hieronder infographic vat de verschillen tussen TATA en CAAT box samen.
Samenvatting – TATA vs CAAT Box
TATA-box en CAAT-box zijn twee delen van het geconserveerde gebied van eukaryote genpromotors. Ze bevinden zich stroomopwaarts van de transcriptie-initiatieplaats. Beide beïnvloeden de transcriptie van genen door te voorzien in plaatsen voor binding van TATA-bindende eiwitten en transcriptie-initiatiefactoren. TATA-box bevindt zich 25-35 basenparen stroomopwaarts van de transcriptie-initiatieplaats, terwijl CAAT-box zich 75-80 basenparen stroomopwaarts van de transcriptie-initiatieplaats bevindt. De consensussequentie van TATA-box is TATAWAW, terwijl de consensussequentie van CAAT-box GGCCAATCT is. Dit is dus de samenvatting van het verschil tussen TATA en CAAT-box.
