Het belangrijkste verschil tussen samengestelde transposons en IS-elementen is dat samengestelde transposons een soort transposons zijn die bijkomende genen dragen, zoals antibioticaresistentiegenen, terwijl IS-elementen (of insertiesequentie-elementen) transponeerbare elementen zijn die alleen genen dragen die code transposase die de omzettingsactiviteit katalyseert.
Een transposon is een DNA-fragment dat zijn positie binnen het bacteriële genoom kan veranderen. Daarom zijn het mobiele DNA-sequenties. Ze verplaatsen zich naar nieuwe locaties van het genoom en brengen veranderingen aan in de volgorde van het bacteriële genoom, wat aanzienlijke veranderingen in genetische informatie veroorzaakt. Transposons zijn ook bekend als springgenen, omdat ze de transcriptie van genen kunnen blokkeren en het genetische materiaal van de bacterie kunnen herschikken. Bovendien zijn ze verantwoordelijk voor de verplaatsing van geneesmiddelenresistentie, antibioticaresistentiegenen tussen plasmiden en chromosomen. Samengestelde transposons en IS-elementen zijn twee soorten mobiele genetische elementen die in bacteriën worden aangetroffen. Beide kunnen van de ene naar de andere locatie in het genoom gaan.
Wat zijn samengestelde transposons?
Een samengesteld transposon is een DNA-segment geflankeerd door twee kopieën van vergelijkbare insertiesequentie-elementen. Er is een centraal eiwitcoderend gebied in samengesteld transposon. De genen zijn vaak antibioticaresistente genen. Ze kunnen ook katabole genen bevatten. Bovendien bestaat composiet transposon uit twee omgekeerde herhalingen. De gehele lengte van de samengestelde transposon beweegt als één complete eenheid.
Figuur 01: Composiet Transposon
Tn10 is een samengesteld transposon. Het bestaat uit een centraal coderend gebied van 6,5 kb (tetracycline-resistente gen) en 1,4 kb omgekeerde insertiesequentie-elementen aan elk uiteinde. IS-elementen leveren transposase. Transposase is een enzym dat de beweging van het transposon katalyseert. Samengestelde transposons kunnen worden geamplificeerd, waardoor primers voor IS-elementen worden ontworpen.
Wat zijn IS-elementen?
Invoegsequentie-elementen of IS-elementen zijn een soort mobiel genetisch element. Ze zijn een eenvoudige vorm van transposons. Ze dragen alleen de genen die coderen voor transposase-enzymen. Transposase-enzymen katalyseren de transpositie van transposons. Structureel wordt de coderende sequentie van IS-elementen geflankeerd door twee omgekeerde herhalingen. Het IS-element met de naam IS911 wordt bijvoorbeeld geflankeerd door twee 36bp omgekeerde herhalende extremiteiten.
IS-elementen zijn de meest voorkomende autonome transponeerbare elementen in het bacteriële genoom. Daarom zijn ze uiterst belangrijk voor de organisatie en evolutie van het prokaryotische genoom. Verder komen IS-elementen voor als onderdelen van samengestelde transposons. In het algemeen worden twee IS-elementen gevonden die de coderende sequentie van het samengestelde transposon flankeren. Maar eenheidstransposons dragen geen flankerende IS-elementen.
Omdat IS-elementen zich binnen het genoom kunnen verplaatsen, kunnen ze de coderende sequentie van andere genen onderbreken en de genen inactiveren door expressie te blokkeren.
Wat zijn de overeenkomsten tussen samengestelde transposons en IS-elementen?
- Zowel samengestelde transposons als IS-elementen kunnen de positie in het bacteriële genoom veranderen.
- Het coderende gebied in beide transposons wordt meestal geflankeerd door omgekeerde herhalingen.
- Een samengesteld transposon wordt geflankeerd door twee afzonderlijke IS-elementen.
Wat is het verschil tussen samengestelde transposons en IS-elementen?
Samengestelde transposons zijn mobiele genetische elementen die bestaan uit twee insertiesequenties (IS's) die vaak een of meer antibioticaresistentiegenen flankeren. Aan de andere kant zijn IS-elementen een soort eenvoudig transponeerbaar element dat genen bevat die coderen voor transposase-enzym om transpositie te katalyseren. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen samengestelde transposons en IS-elementen.
Hieronder staat een lijst met verschillen tussen samengestelde transposons en IS-elementen in tabelvorm voor vergelijking naast elkaar.
Samenvatting – Samengestelde transposons versus IS-elementen
Een bacterieel genoom heeft genetische elementen die mobiel zijn. Samengestelde transposons en IS-elementen zijn twee soorten mobiele genetische elementen. Samengestelde transposons dragen antibioticaresistente genen en flankerende IS-elementen. IS-elementen dragen de genetische code om transposase te produceren dat de beweging van transposons katalyseert. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen samengestelde transposons en IS-elementen.
