Het belangrijkste verschil tussen N-gebonden en O-gebonden oligosachariden is dat N-gebonden oligosachariden worden gevormd wanneer N-atomen van eiwitten binden met een suiker, terwijl O-gebonden oligosachariden zich vormen wanneer O-atomen van serine of threonine binden met een suiker.
Oligosachariden zijn koolhydraatmoleculen die drie tot zes eenheden monosachariden of enkelvoudige suikers bevatten. N-gebonden oligosachariden zijn koolhydraatmoleculen waarbij een oligosacharide aan een stikstofatoom is bevestigd. O-gebonden oligosachariden daarentegen zijn een soort koolhydraten waarbij een suikermolecuul is gehecht aan een zuurstofatoom van een serine- of threonineresidu in een eiwit.
Wat zijn N-gebonden oligosachariden?
N-gebonden oligosachariden zijn koolhydraatmoleculen waarvan de oligosachariden aan stikstofatomen zijn bevestigd. Dit gebeurt door het proces van N-glycosylering. Oligosachariden zijn koolhydraatverbindingen die verschillende suikermoleculen bevatten. Deze worden soms "glycanen" genoemd. Bij het proces van N-gebonden glycosylering komt het stikstofatoom gewoonlijk uit de amidestikstof van een asparagineresidu van een eiwit. Dit proces kan het best worden beschreven op het gebied van biochemie.
N-gebonden glycosylering vindt gewoonlijk plaats in veel eukaryote eiwitten. Bij eukaryoten komt dit veel voor in archaea, maar zelden bij bacteriën. We kunnen de aard bepalen van het N-gebonden oligosacharide dat aan een glycoproteïne is gehecht via het eiwit en de cel waarin het tot expressie wordt gebracht. Het type N-gebonden oligosacharide hangt ook af van de soort organismen.
In een glycoproteïne zijn er gewoonlijk twee soorten bindingen: de binding tussen saccharideresiduen in het glycaan en de binding tussen de glycanketen en het eiwitmolecuul. Daar worden suikerdelen aan elkaar gebonden door middel van glycosidische bindingen. De glycosidische bindingen zijn typisch C1-C4-bindingen. Bovendien vereist de binding tussen een oligosacharide en een eiwitresidu de herkenning van een consensussequentie.
Wat zijn O-gebonden oligosachariden?
O-gebonden oligosachariden zijn een soort koolhydraten waarbij een suikermolecuul is bevestigd aan een zuurstofatoom van een serine- of threonineresidu in een eiwit. Het proces van deze bindingsvorming staat bekend als O-gebonden glycosylering. Het is een posttransitioneel modificatieproces dat plaatsvindt na de synthese van een eiwit.
Als we kijken naar eukaryoten, vindt deze synthese plaats in het endoplasmatisch reticulum, het Golgi-apparaat en soms in het cytoplasma. Bij prokaryoten vindt dit plaats in het cytoplasma. Er zijn verschillende soorten suikers die kunnen binden met serine of threonine. Deze binding kan het eiwit op verschillende manieren beïnvloeden. bijv. handel in cellen in het immuunsysteem, waardoor vreemd materiaal kan worden herkend.
Wat is het verschil tussen N-gebonden en O-gebonden oligosachariden?
N-gekoppelde oligosachariden zijn koolhydraatmoleculen waarbij het oligosacharide is gehecht aan een stikstofatoom, terwijl O-gebonden oligosachariden een soort koolhydraten zijn waarbij een suikermolecuul is gehecht aan een zuurstofatoom van een serine- of threonineresidu in een eiwit. Daarom is het belangrijkste verschil tussen N-gekoppelde en O-gekoppelde oligosachariden dat N-gekoppelde oligosachariden zich vormen wanneer het N-atoom van eiwitten bindt met een suiker, terwijl O-gebonden oligosachariden zich vormen wanneer O-atomen van serine of threonine binden met een suiker.
De onderstaande infographic presenteert de verschillen tussen N-gekoppelde en O-gekoppelde oligosachariden in tabelvorm voor vergelijking naast elkaar.
Samenvatting – N-gebonden vs O-gebonden oligosachariden
Oligosachariden zijn een soort suikermolecuul. Het belangrijkste verschil tussen N-gebonden en O-gebonden oligosachariden is dat N-gebonden oligosachariden worden gevormd wanneer N-atomen van eiwitten binden met een suiker, terwijl O-gebonden oligosachariden zich vormen wanneer O-atomen van serine of threonine binden met een suiker.
