Het belangrijkste verschil tussen dATP en ddATP is dat dATP de DNA-synthese niet beëindigt, terwijl ddATP de DNA-synthese wel kan beëindigen. Dit komt omdat ddATP een H-atoom heeft bevestigd aan de 3ʹ-positie van de pentosesuiker, terwijl dATP een OH-groep heeft bevestigd aan de 3ʹ-positie.
dNTP's zijn bouwstenen van DNA. Er zijn vier soorten dNTP's volgens de purine- of pyrimidinebasen - dATP een van hen. De stikstofbase van dATP is adenosine. ddNTP's zijn nucleotiden die worden gebruikt bij Sanger-sequencing. Er zijn vier soorten ddNTP's. ddATP is een ddNTPs.
Wat is dATP?
Deoxyadenosinetrifosfaat is een nucleotide, een bouwsteen van DNA. DNA-polymerase-enzym gebruikt dATP als substraat voor DNA-synthese. dATP heeft drie componenten: een deoxyribosesuikermolecuul, een adenosine en de drie fosfaatgroepen. Daarom is het een purine-nucleosidetrifosfaat. De chemische formule van dATP is C10H16N5O12 P3, en zijn molecuulmassa is 491.182.
Figuur 01: dATP
dATP verschilt van ATP (adenosinetrifosfaat) in termen van suikercomponenten. ATP heeft ribosesuiker. dATP basenparen met uracil-nucleotide tijdens transcriptie. Naast deelname aan DNA-synthese, kan dATP ook fungeren als een energieoverdragend molecuul om de levensvatbaarheid van de cellen te behouden. Een hoog dATP-geh alte in het lichaam is giftig omdat het kan werken als een niet-competitieve remmer van het enzym ribonucleotidereductase. Het kan leiden tot een verminderde immuunfunctie.
Wat is ddATP?
Dideoxyadenosinetrifoafaat of ddATP is een van de vier soorten nucleotiden die worden gebruikt in de Sanger-sequencingmethode. Structureel heeft ddATP ook drie componenten die vergelijkbaar zijn met dATP. Ze zijn een adeninebase, een deoxyribosesuiker en drie fosfaten.
Figuur 02: ddATP
In tegenstelling tot dATP, mist ddATP een OH-groep op de 3'-positie van de pentosesuiker om een fosfodiesterbinding te vormen met het aangrenzende nucleotide en de ketenverlenging voort te zetten. Het heeft een H-atoom in de 3ʹ-positie. Daarom komt er een einde aan de DNA-synthese zodra ddATP is ingebouwd. Het is het basisprincipe van Sanger-sequencing. Daarom werkt ddATP als een remmer van ketenverlenging bij Sanger-sequencing. Er worden vier buisjes gebruikt bij Sanger-sequencing en ddATP wordt aan één buisje toegevoegd.
Wat zijn de overeenkomsten tussen dATP en ddATP?
- dATP en ddATP zijn nucleotiden.
- Beide zijn samengesteld uit adenine, deoxyribose en drie fosfaten.
- Het zijn organische verbindingen.
- Zowel dATP als ddATP worden toegevoegd aan buizen in Sanger-sequencing.
Wat is het verschil tussen dATP en ddATP?
dATP heeft een OH-groep op de 3'-positie van de pentosesuiker, terwijl ddATP een OH-groep mist op de 3'-positie van de pentosesuiker. Bovendien is dATP een monomeer dat wordt gebruikt bij DNA-synthese, terwijl ddATP wordt gebruikt om ketenverlenging te beëindigen tijdens de Sanger-sequencing. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen dATP en ddATP. Bovendien kan dATP fosfodiesterbindingen vormen, terwijl ddATP geen fosfodiësterbindingen kan vormen.
Onderstaande infographic toont meer verschillen tussen dATP en ddATP in tabelvorm voor vergelijking naast elkaar.
Samenvatting – dATP vs ddATP
Kortom, dATP is een voorloper van DNA-synthese, terwijl ddATP een nucleotide is dat wordt gebruikt om de DNA-synthese in Sanger-sequencing te beëindigen. Bovendien heeft dATP een OH-groep op de 3'-positie van pentosesuiker en maakt het de vorming van een fosfodiesterbinding met het volgende nucleotide mogelijk. Ondertussen mist ddATP de OH-groep op de 3'-positie; daarom is het niet in staat om een fosfodiesterbinding te vormen met het volgende nucleotide. Als gevolg hiervan houdt de DNA-sequentie op met zijn verlenging. Dit vat dus het verschil tussen dATP en ddATP samen.
