Het belangrijkste verschil tussen activatorpromotor en repressor is hun functie. Een activator vergemakkelijkt de opregulatie van het transcriptieproces door te binden aan versterkers, terwijl de promotor de plaats is waar RNA-polymerase bindt en transcriptie-initiatie plaatsvindt, en de repressor de transcriptie neerwaarts reguleert door te binden aan geluiddempers.
Transcriptie is het proces van het synthetiseren van het complementaire mRNA met behulp van een DNA-sjabloon. Het proces vindt plaats in de kern in eukaryoten, terwijl het in prokaryoten plaatsvindt in het cytoplasma. Transcriptie heeft drie hoofdfasen: initiatie, verlenging en beëindiging. Activators en repressors reguleren de transcriptie-initiatie, terwijl promoters belangrijk zijn bij de binding van RNA-polymerase. RNA-polymerase is het belangrijkste enzym dat transcriptie medieert.
Wat is een activator?
Activator is een transcriptionele factor die zich bindt aan de enhancer-regio's om de transcriptie opwaarts te reguleren. Eenmaal gebonden, resulteert het in een verandering in de oriëntatie van de matrijsstreng, waardoor transcriptie wordt geactiveerd of opgereguleerd. Bovendien zal het de binding van RNA-polymerase aan de promotorplaats bevorderen om transcriptie te initiëren.
Figuur 01: Activator
Activators zijn vaak eiwitmoleculen. Ze bevorderen de anabole route van genexpressie. Activatorfunctie wordt voornamelijk waargenomen bij eukaryote transcriptionele regulatie.
Wat is een promotor?
Het promotorgebied van een gen is het gebied waar de RNA-polymerasebinding plaatsvindt bij de start van de transcriptie. Promotorregio's in prokaryoten en eukaryoten variëren. Promotor activatie is een belangrijke stap in transcriptionele controle en activatie. Prokaryotische promotorregio's zijn aanwezig in de -35 en -10 regio's stroomopwaarts van de transcriptiestartplaats. Het -10-promotorgebied wordt ook wel de TATA-box of de pribnow-box genoemd. De sigmafactor van bacteriële RNA-polymerase herkent de promotor en bindt om het gesloten promotorcomplex te vormen. Vervolgens vindt het afwikkelen van de dubbele strengen plaats, wat resulteert in een open promotorcomplex. Ten slotte verlaat de sigmafactor van RNA-polymerase het begin van de transcriptie.
Figuur 02: Promotor
Bij eukaryoten vindt de promotoractivering plaats via meerdere transcriptie-initiatiefactoren. Er zijn twee hoofdtypen promotors in eukaryoten. Het zijn TATA-loze promotors en TATA-promotors.
Wat is een repressor?
Een repressor is een transcriptiefactor die het transcriptieproces downreguleert door te binden aan demperregio's. Dit voorkomt de binding van RNA-polymerase aan de promotor. Dit is de belangrijkste eenheid van het celmechanisme om de transcriptie te stoppen. Hier bindt de repressor aan het dempergebied en blokkeert het transcriptieproces door de snelheid te verlagen en het proces volledig te stoppen.
Figuur 03: Repressor
Transcriptionele repressoren reageren op externe stimuli. Dit voorkomt ook de binding van activatorpromoters aan promotorregio's. Corepressoren zijn een subcategorie van repressoren en onderdrukken transcriptie-initiatie door de rekrutering van histondeacetylase. Histondeacetylase verhoogt de positieve lading op histoneiwit. Dit versterkt de interactie tussen DNA en histonen en vermindert de toegankelijkheid van DNA voor transcriptie.
Wat zijn de overeenkomsten tussen activator-promotor en repressor?
- Activators, promoters en repressors zijn betrokken bij het transcriptieproces.
- Hun belangrijkste rol is tijdens het initiëren van transcriptie.
- Bovendien fungeren ze als transcriptionele regulerende factoren.
- Alle vergemakkelijken de nauwkeurige binding van RNA-polymerase.
Wat is het verschil tussen activator-promotor en repressor?
Activator vergemakkelijkt de opregulatie van het transcriptieproces door te binden aan versterkers. Ondertussen bindt RNA-polymerase aan het promotorgebied tijdens de transcriptie-initiatie. Terwijl de repressor het transcriptieproces neerwaarts reguleert door zich te binden aan geluiddempers. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen activatorpromotor en repressor. Bovendien zijn activators en repressors vaak eiwitten die transcriptie reguleren, terwijl promotor een element van DNA is dat aanwezig is in de stroomopwaartse gebieden van het gen. Bovendien versterken zowel activatoren als promotors het transcriptieproces, terwijl repressoren het transcriptieproces remmen.
De onderstaande infographic presenteert de verschillen tussen activatorpromotor en repressor in tabelvorm voor vergelijking naast elkaar.
Samenvatting – Activator versus promotor versus repressor
Activator, promotor en repressor zijn transcriptionele factoren die de transcriptiesnelheid beïnvloeden. Het belangrijkste verschil tussen activatorpromotor en repressor is dat een activator de opregulatie van het transcriptieproces vergemakkelijkt door te binden aan de versterkers, terwijl de promotor de binding van RNA-polymerase tijdens de transcriptie-initiatie vergemakkelijkt en repressoren de transcriptie neerwaarts reguleren door te binden aan geluiddempers. Activators en repressors zijn vaak eiwitmoleculen die binden aan de regulerende gebieden in het gen en oriëntatieveranderingen in het DNA veroorzaken. Promoters zijn sites stroomopwaarts. Binding van RNA-polymerase vindt plaats op de promotorplaatsen. Dit is dus het verschil tussen activatorpromotor en repressor.
