Het belangrijkste verschil tussen signaalsequentie en signaalpatch is dat signaalsequentie een aminozuursequentie in eiwitten is die een cel ertoe aanzet eiwitten naar organellen of celmembraan te verplaatsen, terwijl de signaalpatch een aminozuursequentie is in eiwitten die een cel ertoe aanzetten om eiwitten van het cytosol naar de kern te verplaatsen.
Eiwittargeting of -sortering is het biologische mechanisme waarmee eiwitten naar hun juiste locaties binnen of buiten de cel worden getransporteerd. De informatie die in het eiwit zelf zit, stuurt dit leveringsproces aan. Correcte eiwitsortering is cruciaal voor de cel. De fouten of disfunctie bij het sorteren kunnen meerdere ziekten veroorzaken. Signaalsequentie en signaalpatch zijn twee sequenties die bestaan uit aminozuren in eiwitten die deelnemen aan eiwittargeting of -sortering.
Wat is een signaalreeks?
De signaalsequentie is een aminozuursequentie in de eiwitten die de cel ertoe aanzet de eiwitten te verplaatsen, meestal naar organellen of het celmembraan. Een signaalsequentie wordt ook wel een signaalpeptide genoemd. Het is een kort peptide dat 16 tot 30 aminozuren bevat. Het is aanwezig aan de N-terminus (soms C-terminus) van de meeste nieuw gesynthetiseerde eiwitten. Signaalsequentie helpt eiwitten naar secretoire routes. De eiwitten die signaalsequenties bevatten, omvatten die welke zich in organellen bevinden (endoplasmatisch reticulum, Golgi-apparaat of endosomen), uitgescheiden door de cel of ingebracht in de meeste celmembranen.
Figuur 01: Signaalvolgorde
Normaal gesproken hebben de meeste type I membraangebonden eiwitten signaalsequenties. De meeste type II en multi-overspannende membraangebonden eiwitten zijn echter gericht op de secretoire route door hun eerste transmembraandomein dat bekend staat als het "doelwitpeptide". Bovendien leiden de signaalsequenties in prokaryoten de nieuw gesynthetiseerde eiwitten naar het SecYEG-eiwitgeleidende kanaal dat aanwezig is in het plasmamembraan. Bovendien bestaat in eukaryoten een homoloog systeem, waarbij de signaalsequenties de nieuw gesynthetiseerde eiwitten naar het Sec61-kanaal leiden. Hoewel dit kanaal structurele en sequentiehomologie deelt met SecYEG, is het aanwezig in het endoplasmatisch reticulum.
Wat is een signaalpatch?
Een signaalpleister is een aminozuursequentie in de eiwitten die een cel ertoe aanzet eiwitten van het cytosol naar de kern te verplaatsen. Een signaalpatch bevat informatie om een bepaald eiwit naar de aangegeven locatie in de cel te sturen. Hoogstwaarschijnlijk leidt het signaalpad het eiwit van het cytosol naar de kern. Het bestaat uit aminozuurresiduen die in de primaire sequentie ver van elkaar verwijderd zijn. Deze aminozuren bevinden zich echter dicht bij elkaar in de tertiaire structuur van het gevouwen eiwit.
Figuur 02: Signaalpatch
In tegenstelling tot signaalsequenties worden signaalpatches na het sorteerproces niet van het rijpe eiwit gesplitst. Signaalpatches zijn erg moeilijk te voorspellen. Nucleaire lokalisatiesignalen zijn over het algemeen signaalpatches, hoewel er ook enkele signaalsequenties bestaan. Bovendien worden signaalpatches gevonden op eiwitten die bestemd zijn voor de kern, die hun selectieve transport van het cytosol naar de kern mogelijk maken via nucleaire poriecomplexen.
Wat zijn de overeenkomsten tussen signaalsequentie en signaalpatch?
- Signaalsequentie en signaalpatch zijn twee sequenties die betrokken zijn bij het richten of sorteren van eiwitten.
- Beide sequenties zijn aanwezig in eiwitten.
- Deze sequenties zijn korte aminozuursequenties.
- De fouten in beide sequenties kunnen een disfunctie veroorzaken bij het sorteren van eiwitten, wat resulteert in meerdere ziekten.
Wat is het verschil tussen signaalvolgorde en signaalpatch?
De signaalsequentie is een aminozuursequentie die in de eiwitten wordt gevonden en die een cel ertoe aanzet de eiwitten naar de organellen of het celmembraan te verplaatsen, terwijl de signaalpatch een aminozuursequentie is die wordt aangetroffen in de eiwitten die een cel aanzet om eiwitten meestal van het cytosol naar de kern te verplaatsen. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen signaalsequentie en signaalpatch. Verder wordt de signaalsequentie na sortering door rijpe eiwitten gesplitst, terwijl de signaalpatch na sortering niet door rijpe eiwitten wordt gesplitst.
De volgende tabel vat het verschil tussen signaalsequentie en signaalpatch samen.
Samenvatting – Signaalvolgorde versus signaalpatch
Signaalsequentie en signaalpatch zijn twee sequenties die in eiwitten worden gevonden. Ze zijn nodig voor het richten of sorteren van eiwitten. Signaalsequentie zet een cel aan om de eiwitten te verplaatsen, meestal naar organellen of het celmembraan. Aan de andere kant zet een signaalpatch een cel aan om eiwitten te verplaatsen, meestal van het cytosol naar de kern. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen signaalsequentie en signaalpatch.
