Het belangrijkste verschil tussen snRNA en snoRNA is dat snRNA de alternatieve splicing van pre-mRNA omvat, terwijl snoRNA het modificeren van rRNA en tRNA, mRNA-bewerking en genoomimprinting omvat.
Klein RNA zijn polymere RNA-moleculen die uit minder dan 200 nucleotiden bestaan. Ze zijn meestal niet-coderend. Ze bestaan tussen boodschapper-RNA's om signalen te dragen. Kleine RNA's zijn afkomstig van perfect dubbelstrengs RNA, dat wordt geproduceerd door de werking van RNA-afhankelijk RNA-polymerase. Kleine RNA's spelen een belangrijke rol bij celdifferentiatie, groei en proliferatie, apoptose, metabolisme, migratie en verdediging. Daarom zijn kleine RNA's belangrijke en kritische regulatoren van ontwikkeling en fysiologie. Klein nucleair RNA en klein nucleolair RNA zijn twee klassen van kleine RNA-moleculen.
Wat is snRNA?
Klein nucleair RNA of snRNA is een klasse van kleine RNA-moleculen die in de kern van eukaryote cellen worden aangetroffen. De gemiddelde lengte van een snRNA is ongeveer 150 nucleotiden. RNA-polymerase II of RNA-polymerase III transcriberen snRNA. De belangrijkste functie van snRNA is de verwerking van pre-messenger RNA in de kern. Ze helpen ook om transcriptiefactoren of RNA-polymerase II te reguleren en telomeren te behouden.
Figuur 01: Werkingsmechanisme van klein RNA
Er zijn twee klassen snRNA op basis van gemeenschappelijke sequentiekenmerken en geassocieerde eiwitfactoren zoals RNA-bindend LSm-eiwit. De twee klassen zijn Sm-klasse snRNA en Lsm-klasse snRNA. Sm-klasse snRNA bestaat uit hoge uridinegeh alten van U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 en U12. RNA-polymerase II transcribeert SM-klasse snRNA. Na de transcriptie van pre-snRNA krijgen ze meestal een 7-methylguanosine 5'-cap in de kern. Vervolgens worden ze via de kernporiën naar het cytoplasma geëxporteerd voor verdere verwerking. Lsm-klasse snRNA heeft een hoog uridinegeh alte van U6 en U6atac. RNA-polymerase III transcribeert Lsm-klasse snRNA en verlaat de kern niet. De meest voorkomende menselijke snRNA-componenten zijn U1 spliceosomaal RNA, U2 spliceosomaal RNA, U4 spliceosomaal RNA, U5 spliceosomaal RNA en U6 spliceosomaal RNA.
Wat is snoRNA?
Klein nucleolair RNA of snoRNA is een klasse van kleine RNA-moleculen die chemische modificaties in ander RNA sturen, zoals ribosomaal RNA, transfer-RNA en klein nucleair RNA. Elk snoRNA-molecuul wordt tijdens het modificatieproces geassocieerd met ongeveer vier kerneiwitten in het RNA / eiwitcomplex. Het snoRNA bevat een antisense-element dat ongeveer 10-20 nucleotiden bevat. Deze basen zijn complementair aan de sequentie rond de nucleotiden die gericht zijn op de modificatie in het pre-RNA-molecuul.
Figuur 02: Klein nucleolair RNA
Er zijn twee klassen snoRNA's. Dit zijn de C/D box snoRNA en H/ACA box snoRNA. C/D-box-snoRNA wordt geassocieerd met methylering en H/ACA-box-snoRNA wordt geassocieerd met pseudo-uridylatie. Elk snoRNA-molecuul fungeert als een gids voor een of twee modificaties in een doel-RNA. C / D-box snoRNA bevat twee korte geconserveerde sequentiemotieven C en D, respectievelijk nabij de 5'- en 3'-uiteinden van het snoRNA. Korte regio's bestaande uit 5 nucleotiden schikken stroomopwaarts van de C-box en stroomafwaarts van de D-box en vormen een stam-boxstructuur. Dit brengt de C- en D-boxmotieven dicht bij elkaar. Stem-box-structuur is belangrijk voor correcte snoRNA-synthese en nucleolaire lokalisatie. H/ACA box snoRNA heeft een secundaire structuur die bestaat uit twee haarspelden en twee enkelstrengs gebieden. Dit is algemeen bekend als de haarspeld-scharnier-haarspeld-staart-structuur. H/ACA box snoRNA bestaat ook uit twee geconserveerde motieven H en ACA. Beide bevinden zich in enkelstrengige regio's. De H-box bevindt zich in het scharnier en ACA bevindt zich in het staartgebied. Drie nucleotiden vormen het 3'-uiteinde van de reeks.
Wat zijn de overeenkomsten tussen snRNA en snoRNA?
- snRNA en snoRNA zijn kleine RNA's.
- Beide zijn aanwezig in eukaryote cellen.
- Beide zijn niet-coderende RNA-moleculen.
- Bovendien nemen ze deel aan het modificeren van RNA tijdens het transcriptieproces.
Wat is het verschil tussen snRNA en snoRNA?
snRNA neemt deel aan alternatieve splitsing van pre-mRNA, terwijl snoRNA voornamelijk RNA-moleculen wijzigt. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen snRNA en snoRNA. Bovendien zijn snRNA's ongeveer 150 nucleotiden lang en worden ze vaak gevonden gekoppeld aan een groep eiwitten en complexen die kleine nucleaire ribonucleoproteïnen worden genoemd. snoRNA's zijn ongeveer 60-170 nucleotiden lang en worden voornamelijk gevonden in de nucleolus.
Bovendien worden snRNA's getranscribeerd door RNA-polymerase II of RNA-polymerase III, terwijl snoRNA alleen wordt getranscribeerd door RNA-polymerase II.
De onderstaande infographic presenteert de verschillen tussen snRNA en snoRNA in tabelvorm voor vergelijking naast elkaar.
Samenvatting – snRNA vs snoRNA
snRNA en snoRNA zijn klassen van kleine RNA-moleculen. snRNA neemt deel aan alternatieve splitsing van pre-mRNA, terwijl snoRNA voornamelijk RNA-moleculen wijzigt. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen snRNA en snoRNA. Klein RNA zijn polymere RNA-moleculen die uit minder dan 200 nucleotiden bestaan en meestal niet-coderend zijn. snRNA's worden gevonden in de kern van eukaryoten. snoRNA's worden gevonden in archaea en eukaryoten. Transcriptie van snRNA vindt plaats via RNA-polymerase II en II, terwijl alleen RNA-polymerase II betrokken is bij het transcriberen van snoRNA. Dit vat dus het verschil tussen snRNA en snoRNA samen.
