Het belangrijkste verschil tussen replicatieve transpositie en knip- en plaktranspositie is dat bij replicatieve transpositie de transposon naar een nieuwe locatie wordt gekopieerd, terwijl bij knip- en plaktranspositie de transposon naar een nieuwe locatie wordt verplaatst.
Transponeerbare elementen of springgenen zijn DNA-sequenties die hun positie binnen het genoom kunnen veranderen. Dit wordt transpositie genoemd. Transpositie kan soms mutaties creëren of omkeren, en de genetische identiteit en genoomgrootte van de cel veranderen. Transpositie werd in 1983 ontdekt door Barbara McClintock. Transpositie kan plaatsvinden door middel van twee technieken, namelijk dupliceren en knippen en plakken.
Wat is replicatieve transpositie?
Replicatieve transpositie is een type transpositiemechanisme dat transposon-excisie van de oorspronkelijke locatie naar een andere helpt door middel van gerepliceerde of gedupliceerde techniek. Dit mechanisme werd voor het eerst gevonden door James A Shapiro in 1979. In dit mechanisme wordt het transponeerbare element gedupliceerd tijdens de transpositiereactie, zodat de transponerende entiteit een kopie is van het originele element. Bovendien vormen in dit mechanisme de donor- en receptor-DNA-sequenties een karakteristieke intermediaire "theta" -configuratie genaamd Shapiro-intermediair (co-integraat). Replicatieve transpositie is een karakteristieke retrotransposon. Dit mechanisme komt normaal gesproken voor in klasse I transposons.
Figuur 01: Replicatieve transpositie
Een goed voorbeeld van replicatieve transpositie kan worden waargenomen in E. coli TN3-transposon. TN3-transposon kan van het oorspronkelijke plasmide naar een ander doelplasmide gaan door middel van gerepliceerde of gedupliceerde techniek. Deze hele gebeurtenis wordt gemedieerd door twee belangrijke enzymen, transposase en resolvase genaamd. Bovendien kan replicatieve transpositie worden waargenomen in zowel DNA-transposons als retroposons. Het best bestudeerde transponeerbare bacteriële virus is de bacteriofaag Mu.
Wat is knippen en plakken transpositie?
Knip-en-plak-transpositie is een type transpositiemechanisme dat helpt bij het transposon-excisie van de oorspronkelijke locatie naar een andere door middel van de knip- en plaktechniek. Dit mechanisme wordt ook wel het conservatieve transpositiemodel genoemd. Bij deze niet-replicatieve transpositie vindt de excisie en integratie van een transposon van de ene genomische locatie naar de andere plaats zonder een kopie achter te laten.
Figuur 02: Transpositie knippen en plakken
In dit mechanisme bindt het transposase-enzym zich eerst aan de terminale herhalingen die gewoonlijk aan beide uiteinden van de transposons aanwezig zijn en vormt vervolgens een structuur die synaptisch complex (transpososoom) wordt genoemd. Het synaptische complex splitst het transposon van zijn oorspronkelijke genomische locatie en integreert het in de nieuwe doellocatie. Daarna vertrekken transposasen aan beide uiteinden van de transposon. Zodra het transposase-enzym het transposon verlaat, worden de gaten opgevuld door het gastheerpolymerase-enzym. Dit maakt de volledige verbinding van het transposon met de nieuwe genomische locatie mogelijk. Dit mechanisme komt normaal gesproken voor in klasse II transposons. Bovendien zijn bacteriële transposons van TN5 een bekend voorbeeld dat een conservatief of knip-en-plak-transpositiemechanisme laat zien.
Wat zijn de overeenkomsten tussen replicatieve omzetting en knippen en plakken omzetting?
- Replicatieve transpositie en knippen en plakken transpositie zijn twee soorten transpositiemechanismen.
- In beide mechanismen gaan de transponeerbare elementen van de ene genomische locatie naar een andere nieuwe genomische locatie.
- Beide mechanismen kunnen mutaties creëren of omkeren en de genetische identiteit van de cel veranderen.
- Bacteriële transposons tonen beide mechanismen.
- Het zijn uiterst belangrijke gebeurtenissen voor evolutie.
Wat is het verschil tussen replicatieve transpositie en knippen en plakken transpositie?
Replicatieve transpositie is een type transpositiemechanisme waarbij de transposon naar een nieuwe locatie wordt gekopieerd, terwijl knippen en plakken transpositie een type transpositiemechanisme is waarbij de transposon naar een nieuwe locatie wordt verplaatst. Dit is dus het belangrijkste verschil tussen replicatieve transpositie en knippen en plakken transpositie. Bovendien vindt replicatieve transpositie normaal plaats in transposons van klasse I, terwijl transpositie met knippen en plakken normaal gesproken voorkomt in transposons van klasse II.
De onderstaande infographic geeft de verschillen weer tussen replicatieve transpositie en knippen en plakken transpositie in tabelvorm voor vergelijking naast elkaar.
Samenvatting – Replicatieve omzetting versus knippen en plakken omzetting
Replicatieve transpositie en knippen en plakken transpositie zijn twee soorten transpositiemechanismen. Replicatieve transpositie is een type transpositiemechanisme waarbij de transposon naar een nieuwe locatie wordt gekopieerd, terwijl knippen en plakken transpositie een type transpositiemechanisme is waarbij de transposon naar een nieuwe locatie wordt verplaatst. Dit vat dus het verschil samen tussen replicatieve transpositie en knippen en plakken transpositie.
